Царь был не стар, но из-за тучности его здоровье было расстроено и подготовило ему, как пишет Ключевский, преждевременную смерть. 28 января 1676 года он благословил на царствие сына Федора, поручил царевича Петра, рожденного 30 мая 1672 года, деду – Кириллу Нарышкину вместе с князем Петром Прозоровским, Федором Головиным и Гаврилой Головиным, приказал выпустить из тюрем всех узников, освободить всех сосланных и 29 января 1676 года умер.

Царь Федор Алексеевич прожил всего 21 год, и поэтому его правление не оставило большого следа в истории России. После его смерти на престол был избран самый младший сын Алексея Михайловича – девятилетний Петр, который в последствии стал самой заметной фигурой на русском престоле.

Царевна Софья, поддержанная стрельцами, добилась, чтобы на русский престол был избран еще один царевич – Иван Алексеевич. И на русском соборе это решение протащили. Таким образом, на царском троне оказались два брата-царя – Петр Алексеевич и Иван Алексеевич. Но ввиду того, что они были малолетними, на время их взросления было принято предложение стрельцов избрать правительницей России их старшую 23-летнюю сестру Софью, которая «отличалась от других замечательным умом и способностями».

По свидетельству князя Б. И. Куракина: «правление царевны Софьи Алексеевны началось со всякой прилежностью и правосудием всем и к удовольствию народному, так что никогда такого мудрого правления в Российском государстве не было; и всё государство пришло во время её правления через семь лет в цвет великого богатства, так же умножилась коммерция и всякие ремесла, и науки почали быть восставлять латинского и греческого языку. И торжествовала тогда довольность народная».

Стрельцам по решению Софьи была добавлена зарплата. По их требованию на Красной площади был сооружен столп с указанием имен «побитых злодеев», участвующих в убийстве, были выданы специальные охранные грамоты. Стрельцы, осмелев, выдвинули ещё одно требование – стоять за старую веру. Среди бояр и народа произошло раздвоение: были люди за старую веру и были люди за новую веру (исправленные книги по вероучению). Борясь между собой они распускали различные выгодные сплетни по Москве, чтоб будоражить народ, в том числе, и о намерении убить государей, царицу Наталью, царевну Софью, патриарха и архиереев. Софья с царским семейством находилась в то время в Коломенском монастыре и вынуждена была переехать в охраняемый монастырь Саввы Сторожевского. Она разослала по городам грамоту, оповещая народ, что стрельцы произвели мятеж и убийства. В конце концов, Петр, заявив брату Ивану о своем старшинстве, приказал Софье покинуть Кремль и уйти в Новодевичий монастырь, взяв с собой 12 человек обслуги. Из дворца ей ежедневно отпускали продукты питания. Софье разрешалось свободно ходить внутри территории монастыря, принимать посетителей.

С падением Софьи началась самобытная деятельность Петра. В январе 1696 года скончался царь Иван. Двоевластие окончилось.

Император России Петр I.

Надо отметить, справедливости ради, что при Софье, с подачи и при содействии князя Голицына В. В., в 1686 году был заключен Московский договор о вечном мире с Польшей, по которому Московское государство принимало участие в коалиционной борьбе с Турцией в союзе с Польшей, Германской империей и Венецией. И таким образом формально вступила в концерн европейских держав, за что Польша навсегда утверждала за Москвой Киев и другие Московские приобретения, временно уступленные по Андрусовскому перемирию. Так же во время царствования Софьи обсуждался вопрос военного строя на немецкий лад, предполагалось увеличить дворянские оклады, труд крестьян заменяла поземельным казенным налогом. Возникла осмысленная необходимость учить боярских детей грамоте, европейской культуре.