В рамках данной методологии М. М. Семаго предлагает ввести в психологию ряд дополнительных категорий, таких как синхронность развития психических структур; фрактальность (изоморфность, самоподобие) структурной организации психического; мера, определяющая динамику и взаимосвязанность (гармоничность) психического развития в целом и в отдельных структурах; принцип триадности анализа. Последний принцип строится на триаде: идеальный онтогенез, идеальный дизонтогенез, индивидуальный вариант развития, – соответственно, продуктом вариативности будут типологические варианты развития. Под идеальным онтогенезом понимается некое оптимальное развитие личности, реализуемое в оптимальных для нее социокультурных условиях, при этом идеальным дизонтогенезом будет «…процесс развития, осуществляемый в условиях некоторой аномалии или патологии». Данный тип не существует в реальности, но представлен учеными в виде модели, категории для рассмотрения закономерностей. Исходя из индивидуальных особенностей ребенка, опираясь на представления об идеальных вариантах онтогенеза и дизонтогенеза, возможно вывести типологическую модель, учитывающую наиболее специфичные и частотные для данного типа отклоняющегося развития закономерности.

На основе триадической структуры в рамках синергетической парадигмы М. М. Семаго предложена авторская трехкомпонентная модель психического развития, а также типология отклоняющегося развития, ставшая необходимой предпосылкой создания конкретных практических технологий психологического сопровождения детей с ограниченными возможностями здоровья в образовательных организациях различного направления. Трехкомпонентная модель анализа психического развития включает в себя каузальный уровень, базовую структурную организацию и феноменологический уровень. На каузальном уровне анализируются нейробиологическая организация, пространственно-функциональная организация мозговых систем и социальные условия развития. То есть, обращаясь к онтологии клинической парадигмы, изучая этиологию дефекта, на уровне базовой структурной организации рассматривают регуляторные структуры обеспечения психической активности, ментальные структуры, аффективную организацию поведения и сознания. Следовательно, эта часть функционирования психики изучается как свойство мозговой ткани в заданных условиях (с учетом дефекта или недостатка). На феноменологическом уровне (чисто психологическом) автор выделяет регуляторно-волевую, когнитивную и аффективно-эмоциональную сферы. Являя собой результат и закономерный итог биологической и физиологической активности, данные сферы психического развития ребенка оцениваются психологами и педагогами как предпосылки для успешного обучения, развития и социализации. На практике в образовательной сфере рассмотрение данных особенностей является наиболее актуальным (и при этом менее изученным) в свете триалогической схемы.

М. М. Семаго подчеркивает важность использования следующих принципов в рамках синергетической методологии: «…представления о точках бифуркации (вероятностных изменениях развития системы), управляющих параметрах, параметрах порядка (переменных, ограниченное число которых может полностью охарактеризовать существующую систему), аттракторах (фазовых траекториях изменения системы). В качестве параметров порядка выступают регуляторный, ментальный и аффективный факторы, определяющие формирование регуляторных структур обеспечения психической активности, ментальных структур, аффективной организации поведения и сознания (по О. С. Никольской). Последние отражают формирование базовой структурной организации как объяснительной модели анализа психического развития» [Семаго, 2013, с. 64].