Проблема инноваций в агропромышленном комплексе напрямую связана с проблемой инвестиционной активности. Кроме того, научная сфера в сельскохозяйственной отрасли также имеет ряд проблем, связанных с недостаточным финансированием. Эту проблему невозможно решить в рамках рыночного механизма, поэтому необходима государственная поддержка и государственное финансирование.

Ряд авторов [39] считает, что любые меры в рамках соглашений ВТО по защите отечественного рынка не имеют смысла без повышения качества продукции. Переход к рыночной экономике не привел к улучшению качества со стороны производителей. Одной из причин, по мнению экономистов [39], является упор на техническое переоснащение, который в корне не верен. Качество продукции состоит из качества проекта и качества изготовления. Выбор технического переоснащения относится к первой составляющей, в результате возникает проблема недостатка инвестиций. Однако вторая составляющая практически не требует инвестиций, в связи с чем рекомендуется переориентироваться на нее, что должно повысить качество продукции.

Возможно, России следует перенять опыт других стран (Китая и Южной Кореи), которые при невозможности промышленности производить качественную продукцию, обращаются к другим предприятиям с предложением о приобретении лицензии. Кроме того, высокого качества можно достичь не путем изменения технической составляющей, а обеспечивая контроль качества продукции [31], например, введением системы управления качеством на государственном уровне [39].

Высокая доля ресурсных затрат в себестоимости продукции, т. е. уровня издержек предприятий в отрасли, обусловлена проблемой технической оснащенности (устаревшим оборудованием), низким уровнем инвестиций в производство, высоким уровнем кредиторской задолженности предприятия, малоквалифицированным персоналом и др. [23]. Зачастую предприятие вынуждено либо устанавливать слишком высокие цены на свою конечную продукцию, чтобы окупить эти затраты, либо работать с убытками. Для решения данной проблемы требуется поддержка предприятий со стороны государства.

Российская система налогообложения подавляет предприятия, а также влечет за собой проблему инвестирования. Сырье, материалы, комплектующие изделия и технологическое оборудование, по мнению некоторых экономистов [31], должны быть освобождены от таможенных пошлин и сборов.

С одной стороны, для России уникальность геополитического положения, т. е. ее природные и климатические условия, является конкурентным преимуществом [43]. С другой стороны, плодородие почв различается в зависимости от региона страны, причем в среднем показатели плодородия намного ниже, чем в других странах.

Основная проблема правовой базы заключается в том, что на сегодняшний день по многим пунктам она не соответствует требованиям ВТО и должна быть изменена. В то же время сельхозтоваропроизводители должны быть уверены в поддержке со стороны государства для поддержания успешного функционирования, поэтому основные пункты должны быть закреплены законодательно.

На сегодняшний день российские сельхозтоваропроизводители не готовы предложить на рынок новый для потребителя продукт с высокими характеристиками, что связано с низкой степенью конкурентоспособности компаний. Показатели степени дифференциации продукции также характеризуются негативно. Для достижения положительных значений по данным параметрам необходима поддержка со стороны государства и обеспечение им благоприятной конкурентной среды на рынке.

С одной стороны, высокая степень открытости рынка для импорта