Новая каменная часовня на могиле схимонаха Зосимы была выстроена при помощи семьи московского купца Дмитрия Михайловича Шапошникова, благотворителя Лукинской женской обители, Подольского уезда. Сам схимонах Зосима трижды являлся Дмитрию Михайловичу в сонных видениях, обнимал его со слезами и просил не оставлять начатого дела. Вскоре был освящен храм во имя Смоленский иконы Божией Матери.
В 1893 г. во втором этаже трапезного корпуса был освящен Сергиевский храм. В 1894 г., по инициативе настоятеля обители архимандрита Павла, на месте первоначального храма, над могилой старца Зосимы, был заложен каменный собор. Средства на его постройку выделил Иван Евфимиевич Ефимов, издатель многих духовных брошюр.
В июле 1900 г. Московским митрополитом Владимиром был освящен средний престол храма во имя Смоленской иконы Божией Матери. Северный его придел был посвящен Архангелу Рафаилу и прочим Небесным Силам бесплотным, южный – св. Зосиме Соловецкому. В соборе были две гробницы. Одна означала место погребения схимонаха Зосимы, другая принадлежала архимандриту Павлу, основателю Смоленского собора.
В 1899 г. над святыми монастырскими воротами был освящен храм во имя Всех святых.
В Смоленской Зосимовой пустыни был пострижен сщмч. Дмитрий (Добросердов).
Более двадцати лет, в Зосимовой пустыни провел Алексий (Соловьев), один из самых известных и почитаемых старцев XX столетия. В монастырь он поступил в конце XIX в., после смерти своей супруги. Пострижен был игуменом Германом (Гомзиным). В 1906 г. Алексий принял подвиг старчества. Он поселился в отдельной избушке, куда приезжали к нему духовные дети и паломники. Была на исповеди о. Алексия и великая княгиня Елизавета Федоровна. Живя в Зосимовой пустыни старец ушел в крепкий затвор. Он продолжал посещать богослужения, молился в алтаре, но и тогда в пустынь продолжали приезжать его духовные дети, чтобы если и не видеть его, то хотя бы молиться со старцем в одном храме. Среди них был будущий священномученик Илья Николаевич Четверухин, которому выпало служить на известных московских приходах.
В 1917 г. о. Алексий был избран членом Всероссийского Поместного Собора и 5 ноября 1917 г. в храме Христа Спасителя он взял жребий, определивший избрание на Патриарший Престол митрополита Тихона (Беллавина).
В 1917 г. монастырь Зосимова пустынь был закрыт, обитель продолжала действовать как сельскохозяйственная артель. В числе последних иноков был иеромонах Герасим (Мочалов). После закрытия обители он перешел в Пешношский монастырь, а потом служил на приходах Московской области, где пострадал от безбожников, и был впоследствии причислен к лику новомученников Российских.
В 1923 г. артель была разогнана. Старец Алексий, к тому времени принявший схиму, вместе со своим келейником переехал в Сергиев Посад, где до самой кончины жил у своей духовной дочери В. Верховцевой. Умер он в 1928 г., был погребен на Кукуевском кладбище в Сергиевом Посаде, в 1994 г. его останки были перенесены в возрожденную Зосимову пустынь.
Монашеская жизнь в Смоленской Зосимовой пустыни возобновилась в 1992 г. Были причислены к лику святых основатель пустыни схимонах Зосима, Герман (Гомзин) и Алексий (Соловьев).
Троицкий Стефано-Махрищский мужской монастырь. Махрищский монастырь был основан около 1370 г. собеседником Сергия Радонежского прп. Стефаном, в лесной дебре, при маленьких речках Махрищи и Молокши.
Прп. Стефан родился в XIV в. в Киеве. Постриг принял в Киево-Печерской лавре. Из лавры ушел вместе со многими монахами, от католических притеснений. Он пришел в Москву, где долго беседовал с великим князем Иваном Ивановичем, испросив у него позволение поселиться в московских пределах, в пустынном месте.