Эксперты ставили и обсуждали ряд теоретических проблем конституционализма в контексте исторической и современной практики конституционного строительства, носящих дискуссионный характер, отмечают существование различных моделей тех или иных конституционных институтов. В числе таких проблем – вопрос о характере конституции: следует ли в ней подробно регламентировать общественные отношения либо достаточно лишь зафиксировать основные принципы с последующим „естественным развитием Конституции“. По мнению Комиссии, авторы российской Конституции избрали промежуточную модель: наряду с закреплением основ конституционного строя дается довольно четкая и подробная регламентация основных конституционных институтов – прав и свобод человека и гражданина, федеративного устройства, президента, правительства, парламента, судебной власти. Отдельные положения, по мнению экспертов, явились результатом политического компромисса.

Плодотворной является мысль экспертов о том, что теория разделения властей эволюционирует, поэтому принцип разделения властей нельзя абсолютизировать, доводить до абсурда. Степень „герметичности“ трех ветвей власти в каждой стране оказывается своей, индивидуальной. Так, по мнению экспертов, в настоящее время велика потребность участия в осуществлении законодательной власти других ветвей власти, а сама законодательная власть не может быть лишена определенных контрольных функций по отношению к другим ветвям власти с учетом их специфики. Основная цель Конституции, по мнению членов Комиссии, заключается в том, чтобы достаточно четко регламентировать отношения взаимозависимости и сотрудничества между законодательной и исполнительной властями. Единственно самостоятельной и независимой, по мнению экспертов, остается судебная власть. В этой связи эксперты полагали, что традиционная для бывших социалистических конституций формула „граждане Российской Федерации имеют право участвовать в отправлении правосудия“ потенциально подрывает судебную власть.

Венецианская комиссия с удовлетворением отметила, что в Конституцию РФ вошли положения о международном праве и международных договорах Российской Федерации как составной части правовой системы, что „является вызовом и главным нововведением“, позволяющим международному праву оказывать прямое воздействие на внутреннее законодательство.

Большим достижением, как полагает польский юрист Кедзя, является появление положения о прямом действии Конституции РФ.

Вполне естественно, что эксперты большое внимание уделили главе 2 Конституции „Права и свободы человека и гражданина“.

Профессор Кедзя отмечает в качестве положительного факта то, что в уточненном тексте Конституции все положения, касающиеся прав и свобод человека и гражданина, сведены в одну главу, и таким образом устранено различие между правами человека, с которым первоначальный проект относил только „классические“ гражданские и политические права, и экономическими, социальными и культурными правами, которые ранее содержались в главе „Граждане Российской Федерации“.

Эксперты отмечали, что в конституционном регулировании прав и свобод человека и гражданина применен „явно выраженный современный и прогрессивный подход“, ибо признается и гарантируется весь основной перечень прав и свобод личности, закрепленный в современных демократических конституциях. Российская Конституция признает верховенство международного права в сфере защиты прав и свобод человека и гражданина.

Среди несомненных положительных изменений экспертами отмечаются введение норм о защите прав человека в условиях чрезвычайного положения, о праве убежища, о правах национальных меньшинств.