Шестнадцатое столетие известно в истории как время больших религиозных реформ в Западной Церкви. Господствовавший там дух религиозных обновлений через начавшееся в том же веке развитие отношений с Русью стал проникать в русский мир. Это нашло свое выражение в появлении ереси жидовствующих, с которой долго боролась Русская Церковь, и лжеучения Бакшина, возникшего под влиянием западного вольномыслия и поддержанного заволжскими старцами [68, с. 138]. У Бакшина нашлось немало последователей, среди которых оказался также Троицкий игумен Артемий.

Артемий, про которого сказано, что «Преподобный Сергий не признал его своим» [45, с. 83], до игуменства жил в Псковском Печерском монастыре, затем в одной из белозерских пустыней, и уже оттуда был вызван в Москву и в 1551 г. поставлен игуменом Троице-Сергиева монастыря. Из любви к просвещению Артемий выхлопотал разрешение перевести преподобного Максима Грека в Троицкий монастырь. По своим взглядам Артемий относился к «нестяжателям». Он, как и Нил Сорский, Максим Грек и старец Вассиан Косой, выступал против обширного монастырского землевладения, а также осуждал строгость мер по отношению к еретикам. Пробыв менее года на игуменской должности, Артемий без видимой причины оставил Троицкий монастырь и удалился в Нилову пустынь.

В 1553 г. в Москве открылся Собор по поводу ереси Бакшина. Здесь Бакшин сообщил о единомыслии с ним Артемия. Тогда Артемия вызвали в Москву и предали суду. С показаниями против него выступили Симеон, игумен Кирилло-Белозерского монастыря, и Нектарий, игумен Ферапонтовой обители, обвинивший Артемия в несоблюдении постов и во многих богохульных мнениях. Кроме них на Артемия показали три свидетеля из Троице-Сергиева монастыря: игумен Иона, старец Игнатий и келарь Адриан Ангелов, который сообщил, что Артемий говорил о бесполезности молитвы за умерших. Сам Бакшин свидетельствовал письменно и устно, что «Артемий изрекал хулы на поклонение святым иконам, на таинство Евхаристии, на предания святых отцов и многие другие» [68, с. 260] [10]. Артемий не смог оправдаться и был приговорен Собором к лишению сана и ссылке в Соловецкий монастырь под строгий надзор. Но недолго он был на Соловках, так как при первой же возможности бежал оттуда в Литву.

Иоанну IV шел всего четвертый год, когда умиравший отец благословил его на великое княжение. Через пять лет умерла и мать его Елена. Началась борьба за власть различных придворных группировок. В ходе этой борьбы часто происходили перед глазами малолетнего Иоанна грубые и иногда кровавые сцены.

Шуйские, ставшие во главе правления, низложили одного за другим двух Московских митрополитов. Никто не беспокоился о воспитании великого князя, у которого под влиянием окружающих его нравов уже в детстве стала проявляться жестокость характера. Предоставленный самому себе, Иоанн рано возмужал и стал самостоятельным. В тринадцать лет он взял правление в свои руки, устранив от власти Шуйских. В семнадцать лет Иоанн первым из великих князей Московских принял царский титул и венчался на царство. Особенным влиянием среди нового царского окружения на молодого царя пользовались митрополит Макарий, более других потрудившийся над его образованием, царский духовник протопоп Сильвестр и окольничий Алексий Адашев.

Царствование Иоанна IV ознаменовалось проведением реформ, направленных на ликвидацию последствий боярского правления. Внутренние реформы, изменившие областное управление, были призваны препятствовать чиновничьим злоупотреблениям и произволу кормленщиков. Утвержденный на Стоглавом Соборе новый царский «Судебник» устанавливал более централизованную систему управления и суда через приказы. При Иоанне IV начали впервые собираться Земские соборы.