Поскольку использование представителей семейства тыквенных очень разнообразно и охватывает различные сферы, актуальным является вопрос о сохранении генетических ресурсов этого семейства. В Европе и Америке, а также в нашей стране предпринимаются большие усилия по сохранению видового разнообразия, создаются коллекции гермоплазмы.
Наиболее крупные и значимые следующие: USDA коллекция гермполазмы растительных ресурсов в Айове (США), институт растительных ресурсов – ВИР (Санкт-Петербург, Россия), Республика Китай и маленькие генетические банки в Мексике, Индии, Испании, на Коста-Рики и Филиппинах (Цаценко Л. В., 2013).
По определению Вавилова Н. И., селекция – это эволюция, направляемая волей человека. Селекцией тыквы в России стали заниматься намного позже, чем селекцией дынь и арбузов. Одними из первых начали селекционную работу с тыквами Быковская, Бирючекутская, Млеевская, Безенчукская и Полтавская опытные станции в период между 1925 и 1930 гг. Работа их была направлена на улучшение местных тыкв, в результате чего были отобраны сорта: Волжская серая, Белая медовая, Мозолеевская, отселектированы: Млеевская, Перехватка 69, Кремянка и некоторые другие.
В последующий период количество отселектированных и улучшенных сортов тыквы возросло до 50%. При этом наметилось несколько направлений в селекции тыквы, но основным направлением оставалось восстановление и улучшение местных сортов, как наиболее приспособленных к местным условиям.
На Грибовской овощной опытной станции, основанной профессором Жегаловым С. И. в 1920 году, существенный вклад в селекцию тыквенных культур был внесен Юриной О. В., разработавшей методы селекции на отдельные хозяйственно ценные признаки. В дальнейшем сорт тыквы крупноплодной Грибовская зимняя, выведенный Юриной О. В. пользовался большой популярностью у потребителей.
Российские селекционеры занимались получением сортов с высоким содержанием каротина в плодах и кустовых форм тыквы. Краснодарской и Бирючекутской опытными станциями выведены высококаротинные сорта мускатной тыквы. Кревченко Л. Е. были созданы такие сорта мускатной тыквы, как Витаминная, Мраморная, Мускатная, занимающие площади в несколько тысяч гектаров.
Ряд опытных станций ведет работу по выведению кустовых сортов у крупноплодной тыквы, для чего используют имеющуюся в коллекции ВИРа ее кустовую форму. В свою очередь, Лудилов В. А. и позднее Соколов Д. И. скрещивали кустовые и плетистые формы и пришли к одинаковому выводу, что в процессе онтогенеза происходит смена доминирования: вначале (до цветения) гибридные растения развиваются как кустовые, а затем как плетистые. Лященко И. Ф. (1934) получил межвидовые гибриды С. maxima с другими культурными видами (твердокорая и мускатная).
Лучшей формой для межвидового скрещивания была китайская тыква ssp. turbaniformis из вида С. maxima. Пангало К. И. в своих многочисленных трудах большое внимание уделял историческим вопросам селекции тыквенных культур в России, их происхождению и классификации. Гольдгаузен М. К. (1938, 1939, 1961) занималась изучением биологии развития тыквенных культур, селекцией на засухоустойчивость и лежкость плодов. Изучению многообразия морфобиотипов тыквенных культур, выявлению новых форм с положительными хозяйственно ценными признаками посвящено очень много работ академика РАСХН Тараканова Г. И.
Во Всероссийском научно-исследовательском институте орошаемого овощеводства и бахчеводства (Астраханская область, г. Камызяк) проделана огромная работа по созданию сортов и гетерозисных гибридов с высокой урожайностью и отличными потребительскими качествами. Выделились новые направления в работе с тыквой крупноплодной, а именно селекция скороспелых, компактных и многоплодных гибридов F1 с комплексом хозяйственно ценных признаков, полученных на основе оригинальной формы с мужской стерильностью. Сотрудниками лаборатории селекции бахчевых культур созданы сорта, которые пользуются большой популярностью не только в регионе, но и по всей России: Крошка, Тамара, Баба Марфа, Аннушка, Вита (Бочарников А. Н., 2016).