Особенно крупных рек на Сицилии нет. Основными являются Симето, Алькантара, Анапо (впадающие в Ионическое море), Торто, Орета (впадающие в Тирренское море), Джела, Сальсо, Южная Имера (заканчивающиеся на южном побережье). Все реки, особенно в приустьевой части, отличаются спокойным, медленным течением. Бурные потоки появляются только после зимних ливневых дождей. Летом многие реки маловодны и даже пересыхают. Внутренних естественных озер на острове мало. Все они невелики по площади и тоже испытывают воздействие летней сухости.

Самое большое из них, Пергуза, летом усыхает до размеров большой лужи возле не слишком обильного источника. Зато на низменных побережьях есть замкнутые и полузамкнутые лагуны, нередко заболоченные: Бивьере-ди-Джела, Пакино, Тиндари, Мессина. На некоторых реках построены плотины и образовались водохранилища; самое крупное из них – Поддзилло.

Климат Сицилии относится к типично средиземноморскому типу с жарким летом и мягкой зимой. Особенно знойным бывает лето на юго-западном побережье, в чем сказывается влияние Африки. Дожди летом обычно редки; во внутренних районах острова отмечается низкая влажность; зато весь остров хорошо проветривается, особенно в прибрежных районах. Зимой внутренние районы гораздо холоднее. Понятно, что на высоченной Этне выпадает много снега, который держится на вершине до середины лета, но и на северном побережье снег не редкость, например в Палермо. Вообще в отношении осадков остров скорее относится к бедным территориям (среднее по острову количество осадков 616 мм в год): только в некоторых районах массива Этны годовое количество осадков может превышать 1300 мм. Низины же нередко страдают от засухи.

В Мессине, считающейся самым дождливым городом Сицилии, среднегодовое количество осадков составляет 893 мм, тогда как во внутренней Энне (расположенной на высоте 949 м) – 695 мм, а в Трапани – всего 452 мм. Если среднегодовое число дождливых дней в Мессине равно 109, то в Трапани – 88, а в той же Энне – 69.

Среднегодовая температура воздуха – около 18,5 °C. Самыми жаркими месяцами на Сицилии являются июль, август и сентябрь, когда средняя максимальная температура воздуха составляет 27–29 °C, самыми холодными – январь и февраль – 15 °C. Осадков больше всего выпадает в январе и декабре, меньше всего – в июле.

Самое большое суточное количество осадков зарегистрировано 17 октября 1951 г. в Лентини (между Катаньей и Сиракузой) – 702 мм.

Особенно неприятны дни, когда на Сицилию налетает знойный сахарский ветер сирокко (здесь говорят: широкко). Тогда летом минимальная температура воздуха подымается выше 30 °C, а максимальная – выше 45 градусов.

В день 10 августа 1999 г., во время очередной волны сирокко, в городке Катенануово был зарегистрирован западноевропейский рекорд жары: 48,5 °C!

Первые поселенцы, появившись здесь, увидели богатый лесами остров, но за тысячелетия хозяйствования человека флора Сицилии заметно истощилась. Леса занимают теперь только 7 % территории острова. Дикая растительность представлена в соновном густыми кустарниковыми зарослями (маккья) или травяными степями. В кустарниковых зарослях хорошо себя чувствуют низкорослые деревья: миртовые, рожковые, лавровые и пр. В горах, как правило, выше 500–700 м произрастают дубы и каштаны, а выше 1300–1400 м, в долинах, среди разнообразных хвойных деревьев попадаются березки местного подвида.

Дикий животный мир острова беден. Из крупных хищников кое-где сохранился волк. Довольно часто встречаются дикие коты и лисы. Последних много на склонах Этны, особенно северных. Лисы охотно едят оставляемую для них туристами пищу, однако в общении с этими хищниками надо соблюдать осторожность, потому что нередко они заражены бешенством. На острове живут также ежи, дикообразы, белки, куницы. В водоемах обитают местные разновидности жаб, иногда достигающих в длину 20 см. В последнее время восстанавливается поголовье полностью истребленных на острове кабанов, для чего животные ввозятся с Сардинии. Из хищных птиц сохранились орлы и соколы, но попадаются они крайне редко.