Семнадцать лет у царя Фёдора с Ириной не было детей.

И против Ирины, хотя ее все любили, возник боярский заговор. Его возглавил митрополит Дионисий и князь Василий Шуйский, они требовали, чтобы государь развёлся с Ириной, а её отправил в монастырь. Но Фёдор очень рассердился на них за то, что от него хотят забрать его любимую жену. Дионисия и князя Шуйского сослали в монастыри. А в мае 1592 года, после почти двенадцати лет брака, у Фёдора с Ириной, к их великой радости, родилась дочь Феодосия. Но, к сожалению, она прожила всего девять месяцев. Это так расстроило Фёдора, что он сильно заболел, у него и так было здоровье слабое. Да так, что полностью и не восстановился, через четыре года, в конце 1597 года умер. По преданию, в час его кончины в кремлёвских палатах ощущалось благоухание. Он пробыл на престоле тринадцать лет и семь месяцев.

После смерти царя Фёдора бояре, опасаясь бедствий междуцарствия, решили присягнуть Ирине. Но уже через неделю после кончины мужа она объявила о решении постричься, удалилась в Новодевичий монастырь и приняла имя инокини Александры, там она и умерла спустя пять лет, за два года до смерти брата.

Династия Рюриковичей закончилась. Прямых наследников на престол не было, а претендентов на царствование было несколько, среди них бояре: Фёдор Романов, племянник последнего царя Фёдора и Василий Шуйский, потомок суздальских князей из рода Рюриковичей. Борьба была жёсткая, длилась она восемь месяцев, но победил шурин царя Годунов Борис. Он уступал конкурентам своей родословной, но за ним был многолетний и в целом успешный опыт управления страной, фактически он и был все это время царем. Это и стало решающим фактором.

В сентябре 1598 года Борис Годунов венчался на царство. Впервые за всю историю России на престол взошёл незнатный, безродный. Годунов чувствовал шаткость своего положения, и это вынуждало его быть подозрительным. Он не доверял ни Шуйским, ни Романовым, ни Мстиславскому, которые имели полное право на престол.

И если первые два года его правления казались лучшим временем России, то начало века казалось уже наихудшим. Годунов все больше становился завистливым и подозрительным. Страх потерять власть только усиливался, он даже создал личную гвардию телохранителей, состоявшую исключительно из немцев, приехавших из Ливонии и Германии. Годунов опасался мести своих соперников, и поэтому поощрял шпионство и доносы, пытаясь таким образом оградить себя и свое семейство от покушений. А сам хладнокровно расправлялся с этими соперниками, и особенно пострадали бояре Романовы.

Романовых было много. Глава семьи Никита Романович Захарьин-Юрьев был братом той самой царицы Анастасии, первой, и самой любимой жены Ивана Грозного. Он был советником Думы, активным и толковым, а после своей смерти у него осталось семь сыновей и шесть дочерей. Старший сын Фёдор, которому было двадцать девять лет, жил с женой Ксенией Ивановной Шестовой, у них родилось шесть детей, одна дочь и пятеро сыновей, но четыре сына умерли во младенчестве. Проживали они с сыном Михаилом и дочерью Татьяной, в доме на Варварке. Вместе с ними жили и младшие братья и его сёстры. Брат Александр с семьёй жил отдельно в своём доме.

Все Романовы были как на подбор, но особенно отличался Михаил: высокий, статный, с удивительной силой, добрый, его все любили. А Фёдор считался первым московским красавцем, щёголем, да ещё и очень умным, он знал английский, сам изучил латынь, любил читать, у него даже была большая библиотека. В тридцать лет он уже командовал русским войском в сражениях со шведами. Позднее историки назвали его русским Ришилье.