Общегосударственные контрольно-организационные отношения возникают в процессе и в результате осуществления контрольной общегосударственной деятельности, т. е. общегосударственного контроля, который в отличие от обычного функционального контроля, являющегося всеобщей управленческой функцией, отличается рядом особенностей: он осуществляется в масштабах всего государства, от имени верховных государственных органов и держит в поле зрения деятельность исполнительной власти и других властей по определенным вопросам.

Общегосударственная контрольная деятельность по определенным вопросам в настоящее время осуществляется Главным контрольным управлением Президента РФ, Счетной палатой Федерального Собрания, Уполномоченным по правам человека в Российской Федерации и некоторыми другими органами.

Главное контрольное управление Президента РФ организует и осуществляет контроль за исполнением законов, указов, распоряжений и поручений Президента в деятельности федеральных и субъектов РФ органов исполнительной власти и их должностных лиц. По результатам этой разновидности общегосударственной контрольной деятельности в сфере исполнительной власти принимаются конкретные меры организационного характера и в случае необходимости вносятся предложения Президенту РФ о принятии соответствующих мер общегосударственного характера по предупреждению нарушений и совершенствованию деятельности федеральных и субъектов Федерации органов исполнительной власти.

Счетная палата РФ в соответствии с Федеральным законом от 11 января 1995 г. № 4-ФЗ «О Счетной палате Российской Федерации» свои полномочия по организации и осуществлению контроля за своевременным, эффективным и целесообразным исполнением федерального бюджета, расходованием государственных средств и использованием федеральной собственности распространяет на все государственные органы и учреждения Российской Федерации, а также на органы местного самоуправления, все предприятия и организации любых форм собственности, если они получают или используют средства из федерального бюджета, управляют федеральной собственностью или используют ее.

Все органы государственной власти, органы местного самоуправления, предприятия, учреждения и организации независимо от форм собственности и их должностные лица обязаны предоставлять запрашиваемую Счетной палатой РФ информацию, а отказ или уклонение должностных лиц от своевременного предоставления информации или документации по требованию Счетной палаты РФ влечет за собой установленную законом ответственность (обычно дисциплинарную).

Деятельность аудиторов и инспекторов Счетной палаты РФ законодательно обеспечена возможностью применения ими мер административного пресечения. Так, при выявлении на проверяемых объектах нарушений, наносящих государству прямой непосредственный ущерб и требующих в связи с этим безотлагательного пресечения, а также в случаях умышленного или систематического несоблюдения порядка и сроков рассмотрения представлений Счетной палаты РФ, создания препятствий для проведения контрольных мероприятий Счетная палата РФ имеет право давать администрации проверяемых предприятий, учреждений и организаций обязательные для исполнения предписания, в т. ч. и руководителям федеральных органов исполнительной власти, членам Правительства РФ, а также руководителям органов исполнительной власти субъектов РФ. А при неоднократном неисполнении или ненадлежащем исполнении предписаний Счетной палаты РФ Коллегия Счетной палаты ФР может по согласованию с Государственной Думой РФ принять решение о приостановлении всех видов финансовых платежных и расчетных операций по счетам проверяемых предприятий, учреждений и организаций.