В то же время считаю оправданным использовать понятие субстрата для построения рационального мировоззрения, в том числе научного. Я рассматриваю идею субстрата в рациональном мировоззрении как идею об обладающей границами лишь частично научно познанной сейчас и в будущем основе мироздания, обеспечивающей единство его конечного предметного многообразия, понимание которой неизбежно изменяется и усложняется по мере развития самого мира и его научного познания и, несмотря на увеличение объективного знания, не способно стать даже относительно сущностно завершенным.

Классическая марксистская философия определяет себя схоже с определением мной субстратологии, называя себя наукой о наиболее общих законах природы, общества и мышления. Однако, в отличие от субстратологии, в моем понимании марксистская философия содержит основанную на вере, хотя она ее отрицает, идею о якобы существовании бесконечного предмета в виде бесконечной материи, понятие которой в действительности не является общим по отношению к понятиям зафиксированных основанной на рациональных доказательствах наукой конечных в каждый момент времени по количеству и характеристикам реальных материальных предметов и является не научным, а идеологическим, как и марксистская философия в целом. В отличие от философии, в рациональной субстратологии как науке понятие субстрата служит для отражения конечных существенных черт мироздания, являющихся основой его предметного единства.

Субстратология как наука нуждается для изучения существенных черт мироздания в специальных методах исследования, в специальном категориальном и терминологическом аппарате исследования, в специальной подготовке исследователей. Поэтому даже очень крупный специалист в каких-либо частных науках может не обладать специальными знаниями в области субстратологии или может обладать ими не на уровне высококвалифицированного профессионала.

Субстратология обобщает знания всех наук, не являясь при этом суммой знаний всех наук. Но субстратология не сводится к обобщению знаний существующих наук. Она способна выходить и должна выходить за их рамки и выявлять путем исследования также те существенные черты мироздания, которые еще не получили хотя бы частичное отражение в существующих науках. Поэтому компетентные суждения о существенных чертах мироздания способны формулировать только специалисты этой науки. Если ученый частной науки одновременно научно осмысливает вопросы мироздания, то он может стать также специалистом в области субстратологии. Многие ученые являются специалистами в нескольких науках. Элементы рациональных знаний, пригодных для субстратологии, содержатся в различных философских учениях, причем содержатся зачастую в деформированном идеологическими идеями виде.

С субстратологией как наукой, которая основана на рациональном взгляде на мир, несовместима идея якобы существования бесконечно идеализированных предметов, напр. бесконечной основы мироздания (бесконечных материи, бога и др.), которая лежит в основе любой идеологии, и ее якобы проявления в конечных предметах, в силу этого тоже мыслимых безгранично идеализированными. В то же время субстратология, как и любая наука, не может обойтись без научных безгранично идеализированных предметов, которые в ней, как и в других науках, изначально мыслятся вообще неосуществимыми, но служат как в качестве средств научного познания, так и в качестве объектов научного исследования. В науке такими неосуществимыми безгранично идеализированными предметами являются, напр., точка, абсолютно черное тело, идеальный газ, машина Карно, машина Тьюринга, абсолютно справедливое общество. Научные безгранично идеализированные предметы субстратологии еще предстоит выработать. Предполагаю, что одним из таких неосуществимых возможных научных безгранично идеализированных предметов субстратологии может стать образ сознательно управляемой человечеством в рамках возможностей, обусловленных объективными законами, нашей Вселенной.