Вторым после губернатора по значимости человеком в колониальной администрации был командующий охранными войсками; зачастую эти две высшие должности занимал по совместительству один человек – бывший военный [129, с. 66]. Если посты губернатора и командующего колониальными войсками занимали разные люди, то именно губернатор решал, как использовать охранные войска. Охранные войска колоний были независимы от Генерального штаба Германии и имели свою собственную организационно-штатную структуру. Однако верховный главнокомандующий вооруженными силами рейха – кайзер являлся и верховным главнокомандующим колониальными охранными войсками, а канцелярией рейхсканцлера проводился кадровый подбор высшего командования, штабов, медицинской службы и служащих военной администрации. В 1907 г. в Берлине было образовано Верховное командование охранных войск колониального управления рейха, которое возглавляли подполковник Фердинанд Кваде (1907–1908), генерал-майор Георг фон Глазенап (1908–1914) и с апреля 1914 года до окончания Первой мировой войны полковник фон Белов [136, с. 120].

Вооруженный контингент каждой немецкой колонии имел свои особенности. Так, охранная часть в Юго-Западной Африке формировалась из немецких добровольцев, прослуживших в германской армии не менее трех лет и хорошо зарекомендовавших себя на службе. Срок службы в колониях составлял 2,5 года с возможностью продления контракта на более длительный срок. Год службы в охранных частях приравнивался к двум годам службы в Германии, участие в карательных экспедициях приравнивалось к году службы [33, s. 55]. Оклад в колонии был значительно выше, чем в германской армии. Так, лейтенант в Африке получал 6300 марок, а в Германии – 1284. За длительную службу в колониях офицеры получали надбавку [152, p. 108]. Кроме жалования военные, заключившие контракт на службу в колониях, получали бесплатно вооружение и обмундирование. В 1892 г. для рядового в Юго-Западной Африке полагалось на год вещевого довольствия: одна куртка с бриджами и штанами, одна пара сапог, одна шляпа, три пары шерстяных рубах, двое трусов, семь пар шерстяных носков, три носовых платка, три полотенца, одно шерстяное одеяло, один ремень с полевым котелком и флягой [63, s. 219]. Продовольственное обеспечение военнослужащих охранных войск включало (в 1908 г.): 500 г мяса или солонины в день, порой заменявшихся 300 г колбасы, сала, ветчины либо мясными консервами. В рацион также входили крупы, макароны, овощи, яйца, фрукты, масло, сахар, 2 бутылки вина в неделю, 100 г коньяка или рома и 1,5 литра сока в месяц, а также табачное довольствие [111, с. 87]. Всем военнослужащим по увольнению со службы полагалось пенсионное обеспечение из государственных бюджетных средств [33, s. 218–234]. В случае смерти офицера на службе вдовам и малолетним детям предоставлялась пенсия [35, s. 239–253]. Все это свидетельствует о том, что военнослужащие в колониях получали довольно хорошее денежное, продовольственное и вещевое обеспечение, а также обеспечивались социальной защитой. Военные контингенты занимались не только присущими им функциями, они также принимали участие в создании инфраструктуры в колониях – строительстве портов, железных дорог, телефонных и телеграфных линий, тем самым способствовали не только охране протекторатов, но и их развитию.

В охранных войсках Восточной Африки, Того и Камеруна немцы занимали только высшие командные должности, солдаты нанимались из местного населения по контракту на пять лет за сравнительно большое, по африканским меркам, жалование. Рядовые аскари (наемники) получали 30 немецких рупий в месяц, сержанты и старшины 50–40 рупий, наименьшее жалованье в охранных войсках получали новобранцы – 20 рупий. В дни государственных праздников каждому солдату и полицейскому выплачивалась небольшая премия в 2–5 рупий [34, s. 7]. Для сравнения: заработная плата африканских рабочих на плантациях составляла от 5 до 10 рупий в месяц [129, с. 68].