Под организацией (ст. 11 Кодекса) понимаются все юридические лица, образованные в соответствии с законодательством России, а также иностранные юридические лица, компании и другие корпоративные образования, обладающие гражданской правоспособностью, созданные в соответствии с законодательством иностранных государств, международные организации, их филиалы и представительства, созданные на территории России. В порядке, предусмотренном Кодексом, филиалы и иные обособленные подразделения российских организаций исполняют обязанности этих организаций по уплате налогов по месту их нахождения (ст. 19 Кодекса). Нужно иметь в виду, что в Налоговом кодексе для юридических лиц употребляется лишь термин «организация», а не «предприятие».

Организации признаются резидентами, если они созданы и зарегистрированы по законодательству России. Такие организации уплачивают налог на прибыль, полученный как на территории России, так и во всех других странах.

Приказом ФНС России от 08.09.2005 г. № САЭ-3-26/439@ «Об утверждении Порядка подтверждения постоянного местопребывания (резидентства) в Российской Федерации» утвержден Порядок подтверждения постоянного местопребывания (резидентства) в России.

ФНС России уполномочена подтверждать статус налогового резидента России для физических лиц (российских и иностранных), российских организаций и международных организаций, имеющих такой статус для целей применения соглашений (конвенций) об избежании двойного налогообложения.

Подтверждение статуса налогового резидента оформляется в форме справки или путем заверения соответствующей формы, установленной законодательством иностранного государства.

Справка, подтверждающая статус налогового резидента России, действительна в течение календарного года, в котором таковая выдана. Справка может быть выдана не только за текущий календарный год, но и за предыдущие годы при условии наличия всех необходимых документов, соответствующих запрашиваемому периоду.

Подтверждение статуса налогового резидента осуществляется по принципу «одного окна» Управлением международного сотрудничества и обмена информацией ФНС России. Заявления налогоплательщиков могут быть направлены в Управление по почте либо переданы непосредственно в экспедицию ФНС России. Срок официального подтверждения статуса налогового резидента составляет 30 календарных дней со дня поступления всех необходимых документов в ФНС России.

Иностранные организации являются плательщиками российских налогов, если они осуществляют деятельность на территории России через постоянное представительство, а также в случае получения доходов от источников в России. Под постоянным представительством понимается филиал, представительство, отделение, бюро, контора, агентство, любое другое обособленное подразделение или иное место деятельности этой организации, через которое организация регулярно осуществляет предпринимательскую деятельность на территории России, связанную с пользованием недрами и (или) использованием других природных ресурсов; проведением предусмотренных контрактами работ по строительству, установке, монтажу, сборке, наладке, обслуживанию оборудования, в т. ч. игровых автоматов; продажей продукции с расположенных на территории России и принадлежащих этой организации или арендуемых ею складов; оказанием услуг и осуществлением иных видов деятельности (ст. 306 Кодекса).

В частности, с 2006 г. налогоплательщик, имеющий несколько обособленных подразделений на территории одного субъекта РФ, может самостоятельно выбрать обособленное подразделение, которое будет уплачивать налог на прибыль, поступающий в бюджет этого субъекта РФ, исчисленный из совокупности показателей этих обособленных подразделений. Об этом решении уведомляются налоговые органы, в которых обособленные подразделения стоят на налоговом учете (п. 2 ст. 288 Кодекса).