Однако население Западного Памира продолжало подвергаться насилию и постоянному грабежу со стороны афганцев. С целью предотвращения дальнейшей эскалации напряженности в этом районе летом 1894 года Россия направила на Памир специальный отряд под командованием генерал-майора М. Е. Ионова.
Передислокация большого количества афганских войск на Западный Памир заставила М. Е. Ионова разделить свой отряд на две рекогносцировочные группы, которые должны были обособленно спуститься по рекам Гунт и Шахдара до их впадения в Пяндж. Продвижению этих групп по неизведанным местам помогало местное население.
25 июня 1894 года военный отряд под командованием капитана А. Г. Скерского [31] выдвинулся из Джавшангоза и начал спускаться вниз по Шахдаре. Недалеко от селения Барваза отряд встретили афганские войска, вчетверо превосходившие русских по численности. Это заставило А. Г. Скерского действовать осторожно и отступить к урочищу Верздара. Между тем лазутчики-таджики постоянно информировали русских, что к афганцам прибывает подкрепление.
Афганские войска, зная о малочисленности русского отряда, вели себя вызывающе, но атаковать русских не решались.
В начале августа афганские войска начали медленно отступать вниз по реке и заняли оборону в крепости Рошт-Кала. 19 августа к Рошт-Кале начал подходить отряд генерала М. Е. Ионова. Узнав об этом, афганские войска начали поспешно отступать по реке к Хорогу, а затем через Пяндж перебрались на афганскую сторону.
В конце августа генерал М. Е. Ионов подошел к Хорогу, где встретился с отрядом подполковника Н. Н. Юденича [32], который с Восточного Памира по реке Гунт подошел к Хорогу. До 15 сентября генерал М. Е. Ионов провел две дополнительные рекогносцировки. Первую – до крепости Калаи Вомар в Рушане, вторую – вверх по реке Пяндж до местечка Кухи Лала. В результате со всех этих территорий афганские войска под натиском русских войск вынуждены были уйти в Афганистан.
Однако после ухода русских войск в который раз афганские войска вновь перешли на территорию Западного Памира, чтобы насиловать, грабить, убивать. В сторону Восточного Памира потянулись вереницы измученных людей, которые у русских искали защиту и покровительство.
Для прекращения беспорядков, чинимых афганцами на Западном Памире, генералом М. Е. Ионовым было принято решение об отправке в Хорог, Рушан и Вахан офицерских разъездов. Узнав об этом, афганцы начали покидать Западный Памир.
В течение четырех лет, с 1892 по 1895 г., в экспедициях М. Е. Ионова участвовал журналист Б. Л. Тагеев [33], который вел не только дневниковые записи, но к тому же увлекался и фотографией, войдя в историю как нештатный фотокорреспондент полковника М. Е. Ионова. Первые рассказы и фотографии Б. Л. Тагеева о военных походах на Памир были опубликованы в популярном российском журнале «Нива» и затем вошли в книгу, изданную в Санкт-Петербурге в 1900 году, под названием «Русские над Индией». В 1902 году в Варшаве вышло более полное издание этой книги под названием «Памирские походы. 1892–1895». Благодаря Б. Л. Тагееву сегодня с документальной точностью можно воспроизвести процесс присоединения Восточного и Западного Памира к России, жизнь и быт русских солдат и местных жителей, природный мир края.