Кроме рассмотрения этих вопросов совещание признало необходимым отправить на Памир отряд русских войск, поскольку замедление в принятии этой военной меры могло привести к печальным последствиям, нарушив безопасность и спокойствие Ферганской области и нанести большой ущерб всему русскому престижу в Средней Азии. Однако на совещании было также оговорено, что во избежание осложнений в отношениях с соседними государствами отряд не должен углубляться на территорию Памира, а должен остановиться в Алайской долине, не далее реки Мургаб, и отсюда охранять спокойствие Памира, не вступая и избегая вооруженных столкновений.

Вопросы русско-английских отношений на Памире были также обсуждены в мае 1892 года между тайным советником России в Лондоне Е. Е. Стаалем [25] и министром иностранных дел Англии лордом Солсбери. На этих переговорах было достигнуто предварительное соглашение о том, что, если Россия не предпримет каких-либо действий на Памире, Англия не будет претендовать на этот край.

С целью реализации достигнутых договоренностей 2 июня 1892 года из Ферганы отряд полковника М. Е. Ионова [26] в составе 53 офицеров, 906 нижних чинов и 588 строевых, верховых и подъемных казачьих лошадей, направился на Памир.

Первое временное русское укрепление на Памире было заложено в местечке Шаджан при слиянии рек Ак-Су и Ак-Байтал с Мургабом. К концу августа солдаты отряда под руководством военного инженера А. Г. Серебренникова построили военное укрепление.

По распоряжению М. Е. Ионова на зимовку остались 160 человек пехоты из отобранных охотничьих команд и 40 казаков во главе с капитаном генерального штаба П. А. Кузнецовым [27]. Перед ними была поставлена задача по охране Восточного Памира от афганско-маньчжурских войск и происков англичан.

Весной 1893 года на Западный Памир был отправлен рекогносцировочный отряд под командованием поручика Рукина, который должен был продемонстрировать войскам афганского эмира, что Россия не отказывается от своих прав на бекства, расположенные в долине реки Пяндж. В связи с этим Рукиным был организован хоть и временный, но первый на Западном Памире наблюдательный пост в Рушане, в крепости Калаи-Вомар. Такой же пост был установлен и в долине реки Бартанг, куда прибыл другой рекогносцировочный отряд под командованием штабс-капитана С. П. Ванновского [28].

С. П. Ванновскому, кроме того, также предписывалось пройти по маршруту от крепости Таш-Курган, расположенной на реке Бартанг, вверх по течению и произвести рекогносцировку путей из долины Бартанг в долину Язгулем, связав таким образом ранее неизвестные европейцам части Рушана и Дарваза. Преодолевая неимоверные трудности, небольшой отряд прошел по горному бездорожью и выполнил поставленную перед ним задачу.

А тем временем начальником Памирского поста был назначен капитан В. Н. Зайцев [29]. Имея в своем распоряжении роту пехоты 4-го Туркестанского линейного батальона, до полусотни казаков, расчет двух пулеметов, взвод конно-горной батареи и под техническим руководством военного инженера А. Г. Серебренникова, в более удобном месте было воздвигнуто новое постоянное Памирское укрепление, получившее название Мургаб.

Одновременно в 1894 году, в противовес британской активности в регионе, началось строительство в глубокой тайне секретной военно-стратегической колесной дороги на Памире через перевал Талдык высотою 3615 м, соединившей Ферганскую и Алайскую долины. Дорога строилась под руководством подполковника Б. Л. Громбчевского