С XI в. в Болонье начинает формироваться принципиально новое учебное заведение на основе школ глоссаторов (от слова «глосса» – комментарий на полях). Глоссаторы занимались критикой и толкованием римского права, которое благодаря их усилиям утвердилось как универсальное. Кроме того, действовал и болонский центр по составлению свода законов, образующих основу для изучения церковного права. В 1158 г. согласно указу императора Фридриха Барбароссы болонским объединениям юристов придается статус studio generale, т. е. школы, носящей всеобщий характер. Это первый европейский университет.
Впоследствии в ряде городов Европы объединяются различные школы и превращаются в крупные учебные центры, которые стали называться университетами. Так возник Парижский университет (1200), объединивший богословскую школу Сорбонны с медицинской и юридической школами. Подобным образом возникли университеты в Оксфорде (1168), Кембридже (1209), Падуе (1222), Тулузе (1229). Права каждого университета подтверждались уставами и привилегиями от папы, императора или королей. Это были особые документы, которые закрепляли университетскую автономию (собственный суд, управление, право на присуждение ученых степеней, на освобождение студентов от военной службы). С середины XIII в. в университетах стала вводиться система оплаты труда преподавателей при помощи церковных бенефициев (от лат. – благодеяние) или жалованья от светских властей. Сеть университетов в Европе расширялась довольно быстро, с начала XII по XV вв. был создан 81 университет, многие из них действуют и в настоящее время.
Первые европейские университеты существенно отличались от современных. У них не было собственных зданий и библиотек. Занятия проходили в частных зданиях или католических соборах. Книги для обучения студенты брали на время, так как они были рукописными, а посему очень дорогими. Возраст обучающихся колебался в пределах от 14 до 20 лет. Многие студенты посещали университеты, чтобы сделать карьеру. Наиболее популярным было изучение права.
Во второй половине XIII в. в университетах появились факультеты, которые присуждали ученые степени бакалавра, а затем – магистра, доктора или лиценциата (в переводе с латинского – допущенный, т. е. преподаватель, получивший право читать лекции, но еще не защитивший докторской диссертации). Магистр для получения лицензии на преподавание должен был сдать экзамен на знание наиболее важных текстов. В университете избирался ректор, который наделялся полномочиями его руководителя, как правило на один год.
В основу обучения в средневековых университетах была положена система семи «свободных» искусств. На начальном этапе изучались грамматика, риторика и диалектика, так называемый «тривиум», впоследствии – арифметика, геометрия, астрономия и музыка (квадриум), а затем студент специализировался в гражданском или каноническом праве, философии, медицине или теологии.
Основными формами занятий были лекции и диспуты. Обычно в университетах читались профессорами лекции по какому-либо тексту. Постепенно преподаватели стали включать в свои лекции не только комментарии к тем или иным текстам, но и вопросы, ответы на которые можно было найти путем логических умозаключений. С течением времени вопросы в значительной степени вытеснили комментарии.
Чаще всего формой организации занятий были диспуты. В ходе так называемых ординарных диспутов одни студенты по заданию преподавателя готовили аргументацию «за», другие – «против». После обсуждения преподаватель подводил итоги, т. е. давал канонический ответ на обсуждаемый вопрос. Студент, который мог самостоятельно, а главное аргументированно ответить на тот или иной вопрос, после 4–5 лет обучения получал степень бакалавра. Многие студенты после этого завершали свое обучение, те, кто стремился к степени магистра и последующему преподаванию, продолжали обучение 2–3 года.