В 2015 году судебный процесс над Ульбрихтом завершился. Он был признан виновным по семи пунктам обвинения. В том числе за организацию наркоторговли приносившую продавцам более двухсот миллионов долларов дохода. Обвинение пыталось привлечь Ульбрихта также за организацию нескольких заказных убийств, однако пострадавших и прямых доказательств этого представлено не было. Ульбрихт был приговорен судом Нью-Йорка к пожизненному заключению.

Веб-сайт Ульбрихта предоставлял финансовые гарантии подпольным дилерам и их клиентам, взимая с каждой сделки свой процент. К моменту ареста оборот наркотиков и других нелегальных товаров через Шелковый путь достиг 213 миллионов, а комиссия торговой площадки составила 13,2 миллионов долларов. Выручка от проданной Службой федеральных маршалов США (United States Marshals Service, USMS) криптовалюты с кошельков веб-сайта составила миллионы настоящих долларов.

В 2014 году ФБР закрыла Silk Road 2.0 и арестовала его нового владельца 26-летнего Блейка Бентхола (Blake Benthall). Его ресурс действовал и управлялся так же, как и первый Шелковый путь. Бентхолу были предъявлены обвинения в незаконном обороте наркотиков, организованном отмывании денег, взломе компьютеров и причастности к распространению поддельных документов.

Предполагается, что через Silk Road 2.0 многим тысяч покупателей со всего мира были отправлены сотни килограммов наркотических веществ. На момент закрытия оборот площадки составлял около восьми миллионов долларов, а база зарегистрированных пользователей достигла примерно 150 тысяч логинов.

В 2006 году спецслужбы Германии осуществили захват шести компьютеров, работавших узлами сети TOR на основании того, что они были незаконно использованы для доступа к детской порнографии.

В 2007 году немецкая полиция арестовала в Дюссельдорфе человека создавшего на своём компьютере сервер TOR, через который было отправлено ложное сообщение о теракте.

В 2009 году в чёрный список китайского «Золотого щита» (The Golden Shield Project именуемый также в Сети как «Великий Китайский Фаервол») были включены 80% IP-адресов публичных серверов TOR.

В 2014 году появились сообщения, что террористическая группировка, связанная с исламистской организацией ISIS1 (Исламское государство Ирака и Леванта, признана в России экстремистской организацией, и ее деятельность запрещена) в Северной и Южной Америке, привлекает финансирование в Bitcoin, которая позволяет проводить анонимные транзакции.

В 2015 году полиция Швеции вернула арт-коллективу Mediengruppe Bitnik интернет-бот, с помощью которого на посвященной темной зоне Интернет выставке осуществил через TOR специфические покупки. Были приобретены нелегальные товары – наркотик экстази, набор ключей-отмычек для пожарников, блок сигарет «Chesterfield», платиновая карточка VISA, бейсболка со скрытой видеокамерой и контрафактная одежда.

Закрытие «Шелковых путей», и таких площадок как «Hydra», «Cloud9», «Cannabis Road» и других лишь эпизоды в борьбе правоохранителей с анонимной или нелегальной деятельностью в Сети. В 2014 году в рамках совместной операции, участниками которой стали 16 стран Европы и США, закрыто более 400 сайтов в сети TOR. Все они продавали запрещенные товары, включая оружие и наркотики.

В «темной зоне» периодически размещаются похищенные данные. В 2015 году архив размером в 9,7 Гб (логины и пароли, имена и адреса 32 миллионов пользователей) веб-сайта Ashley Madison был размещён на веб-сайте с доменом». onion» в сети TOR. В опубликованной базе данных содержалась история платежей по картам клиентов Ashley Madison.