Александр I и Франц II бежали с поля битвы ещё задолго до окончательной катастрофы. При этом Александр дрожал, как в лихорадке, и плакал, потеряв самообладание. Его быстрое бегство продолжалось и в следующие дни. Раненый Кутузов едва спасся от плена. К вечеру 2 декабря стороны могли подводить итоги, главным из которых можно считать тот, что Третья коалиция распалась. Русская армия впервые со времён Петра Великого проиграла генеральное сражение. Победоносный угар русского императора сменился полным отчаянием. «Смятение, охватившее союзное руководство, было так велико, что вся свита Александра I рассеялась в разные стороны и присоединилась к нему только ночью и даже наутро. В первые же часы после катастрофы царь скакал несколько вёрст лишь с врачом, берейтором, конюшим и двумя лейб-гусарами, а когда при нём остался лейб-гусар, царь, по словам гусара, слез с лошади, сел под деревом и горько заплакал».14

Карта «Сражение под Аустерлицем»

Архив Военного министерства Франции хранит следующие данные о потерях сторон при Аустерлице: союзники – 15 тысяч убитых и раненых, 20 тысяч пленных (среди них 8 генералов), 180 орудий, 45 знамён; французы – 1290 убитых и 6943 раненых. Заметим, что в России с этими данными соглашался только академик Евгений Викторович Тарле (1874—1955 гг.). Все остальные наши историки – и дореволюционные, и советские – подсчёты французов взяли под сомнение и в большинстве своём оперировали цифрами Михайловского-Данилевского: потери союзников – 27 тысяч человек убитых, раненых и пленных, в том числе 21 тысяча русских, 158 орудий, 30 знамён; потери французов – до 12 тысяч человек.

Художник Франсуа Жерар «Наполеон при Аустерлице»

Итоги войны Третьей коалиции. Вскоре после Аустерлица, 26 декабря 1805 года, Австрия заключила с Францией Пресбургский мир. Согласно этому миру, Австрия уступала Наполеону, как королю Италии, Венецианскую область, Истрию (кроме Триеста) и Далмацию и признавала все французские захваты в Италии. Кроме того Австрия лишалась всех своих владений к западу от Каринтии, которые переходили под власть главных союзников Наполеона в империи: Курфюршество Бавария получило Тироль с Бриксеном и Трентом, Форарльберг, правобережье Инна, Бургау и Линдау, а также Пассау и Айхштет, отторгнутые от Зальцбургского курфюршества; Курфюршество Вюртемберг приобрёло бывшие австрийские владения в Швабии: Альтдорф, Гогенберг, Нелленбург, Эхинген и Бондорф; Курфюршество Баден получило Констанц, а также территорию герцогства Брейсгау, включая Фрайбург и Ортенау.

В итоге войны Австрия была полностью вытеснена из Германии и Италии. Франция утвердила свою гегемонию на европейском континенте. 15 марта 1806 года Наполеон передал герцогство Юлих-Клеве-Берг во владение своему шурину Мюрату. Также Наполеон изгнал из Неаполя местную династию Бурбонов, которая бежала на Сицилию под защиту английского флота, и 30 марта посадил на неаполитанский престол своего брата Жозефа. 24 мая 1806 года он преобразовал Батавскую республику в Голландское королевство, поставив во главе его другого своего брата Людовика.

12 июля 1806 года Бавария, Вюртемберг, Баден, Гессен-Дармштадт, Нассау, Берг, архиепископство Регенсбург (эрцканцлер Карл Теодор Дальберг) и восемь других немецких княжеств подписали в Париже договор об образовании Рейнского союза под покровительством Наполеона. После чего 1 августа эти государства объявили о своём выходе из состава Священной Римской империи. А уже 6 августа 1806 года австрийский император Франц II под давлением Наполеона был вынужден отказаться от германской короны. Таким образом, Священная Римская империя прекратила своё существование.