Воспитанием сына занималась его мать. По традиции он обучался вместе с персами и греками. Проявил себя одаренным, усердным учеником, особенно в овладении греческой письменностью, познаниями в культуре и религии. Увлекался воинскими упражнениями, верховой ездой и охотой на диких зверей, что являлось обязательным для знатных персидских семей.

Накануне того, как Митридат V Эвергет был отравлен, а произошло то в 120 году до нашей эры, мать воспротивилась тому, чтобы единственным преемником стал старший сын Митридат. Поэтому Понтийское царство перешло под совместное правление Лаодики VI, Митридата и его младшего брата Митридата Хреста. Поскольку сыновья были несовершеннолетними, то в качестве регента страной с 120 по 113 год управляла их мать, отдававшая предпочтение младшему сыну Хресту.

Поскольку убийство, чаще всего с применением яда, царственных родственников в эллинистических государствах было привычным делом, то Митридат, оказавшись в положении изгоя, опасался за свою жизнь. Он сбежал в Малую Армению под покровительство правителя Антипатра, завещавшего ему собственные владения. Но в период между 116–113 годами до н. э. Митридат вернулся в Понт, и был провозглашен царем. Он сохранил матери и брату жизнь. Однако они были наказаны: Лаодика VI умерла в тюрьме. Неизвестно, по естественным причинам, или была убита по приказу сын? А вот Хрест заплатил жизнью за участие в заговоре против Митридата, который устроил ненавистным родственникам пышные похороны. Такие тогда вокруг трона царили коварные и жестокие нравы.

Неслучайно Митридат, не доверяя окружению, особенно претендентам на корону, правителям враждебных государств, длительное время небольшими дозами употреблял яд. Под его воздействием в организме возник стойкий иммунитет.

Расправившись с внутренними врагами, которых сейчас бы назвали «пятой колонной», посягающей на престол, Митридат приступил к осуществлению своей мечты о создании мощного государства. К тому времени последний представитель династии Спартокидов, правивший Боспорским царством, уступил трон Митридату. Его войска вторгаются на территорию Боспора и жестоко подавляют восстание рабов и бедноты под руководством скифа Савмака, удерживавшего власть не более года. Понтийские войска во главе с Митридатом, окончательно присоединили Боспор к Понту. Затем подчиняет соседнюю Колхиду, захватывает Малую Армению, Херсонес Таврический и часть скифских оседлых племен в Таврии. Заключаются союзы со свободными племенами скифов, бастарнами и фракийцами.

Став властителем основные причерноморские государства, Евпатор завладел большими ресурсами для войны с главным противником – Римской империей.

Боспорцы и жители греческих полисов обеспечивали потребности армии и флота, в котором насчитывалось до 400 боевых кораблей, деньгами, хлебом, рыбой и другими продуктами питания. А воинственные племена, в качестве наемников пополняли понтийскую армию наемной живой силой и конницей. Влияние близи границ Римской империи Митридат достигал не только силой оружия, но и расширением родственных связей. В частности, свою дочь выдал замуж за армянского царя Тиграна. Рассчитывал на то, что тот в случае необходимости предоставит войска.

Митридат VI Евпатор, соперничая с Римом, стремился подчинить себе народы не только в Малой Азии, но и сопредельных государств, прежде всего в Греции. Весной 88 года до н. э. он вторгся в римскую Азию и без труда захватил ее. Коренное население приветствовало Митридата, как освободителя от римского господства. Когда войска боспорского царя двинулись через Македонию в Грецию, то в Риме осознали опасность. Собрано большое войско под командованием консула Суллы для отражения армии Митридата. Лишь междоусобная борьба отсрочила поход римского войска на восток, в Грецию.