К началу сентября (намного ранее положенного срока) 5-й полк уже был готов выступить. 2 сентября он и выступил на Лубны, Пирятин, Прилуки – до Борзны, далее направился, как и все казачьи полки, до Калуги и Тулы. Командование полком вместо Котляревского принял подполковник Санковский, который догнал подразделение в Черниговской губернии.

В дальнейшем полк соединился с объединенным Полтавским и Черниговским ополчением под начальством генерал-лейтенанта графа Н. В. Гудовича. Кроме 5-го Полтавского казачьего полка в его состав также вошли 1-й Полтавский, 2-й Полтавский, 3-й Полтавский, 4-й Полтавский, 6-й Полтавский, 7-й Полтавский, 8-й Полтавский, 9-й Полтавский, 1-й Черниговский, 2-й Черниговский, 4-й Черниговский и 5-й Черниговский.

3-й Черниговский полк в сентябре 1812 г. не вошел в состав объединенного ополчения, он поступил в состав 2-го Резервного корпуса генерал-лейтенанта Ф. Ф. Эртеля. При этом все полки активно участвовали в боях на территории Могилевской губернии осенью 1812 г. В 1813–1814 гг. 3-й Черниговский полк состоял при генерал-интенданте всех действующих армий генерал-майоре Е. Ф. Канкрине.

После боев в Могилевской губернии объединенное ополчение получило поручение конвоировать пленных, содержать летучую почту и сопровождать транспорты, следовавшие в действующую армию. В начале февраля 1813 г. казачьим полкам было предписано следовать в герцогство Варшавское. Уже на марше оно было остановлено генерал-майором, князем Н. Д. Кудашевым, которому поручено сформировать из малороссийских казачьих полков летучий отряд. Однако это решение было отменено и части простояли без какого-либо назначения до середины июля 1813 г. на территории Гродненской губернии, а в августе вошли в состав корпуса генерал-лейтенанта С. Л. Радта, блокировавшего крепость Замостье. После сдачи крепости, в ноябре 1813 г., конвоировали пленных, а в начале сентября следующего года ополчение откомандировано в распоряжение генерал-губернатора герцогства Варшавского для несения полицейской службы.

Накануне войны с Францией в Российской империи начали проводить мероприятия, направленные на укрепление обороноспособности основных крепостей. В первую очередь это касалось тех из них, которые располагались в непосредственной близости от западной границы. В то же время во внимание принималась также важность стратегического расположения некоторых городов, в частности Киева. Основным препятствием для проведения работ было отсутствие надлежащего финансирования (особенно учитывая ведение войны с Турцией с 1806 г.), необходимость которого определялась достаточно критическим состоянием местных крепостных укреплений.

Напомним, что еще в XVIII в. в императорских документах («Рассуждения Е. И. В. в крепостях» 1724 г., «Рассуждение учреждаемой при императорском Дворе воинской комиссии» 1730 г. и «Высочайше конфирмованной в крепостях ведомости» 1763 г.) определялась важность содержания в Киеве двух крепостей – Старокиевской и Киево-Печерской.

В 1803 г. фортификационное состояние первой из них было признано неудовлетворительным еще «с давних времен» и, следовательно, уже не предусматривалось выделение финансирования для содержания ее в надлежащем состоянии. В том же году была организована специальная инженерная экспедиция, которая обследовала Киево-Печерскую крепость.

Главной причиной потери оборонного значения старых киевских валов (на основе которых и была создана Старокиевская крепость) стало значительное расширение границ города и постепенное разрушение валов под влиянием природных факторов. Также следует сказать об отсутствии надлежащего ухода за ними. Кроме того, местная администрация способствовала их уничтожению, несмотря на их важность как архитектурного и исторического памятника. В частности, с середины XVIII в. началось постепенное засыпание Золотых ворот с валом, а к концу века были разрушены Софийские (Батыевы) ворота. Параллельно с этим процессом происходило сосредоточение гарнизона Киева в Печерской крепости. В конце концов «старокиевские валы заросли деревьями и кустарниками и стали местом праздничных прогулок для народа». Учитывая, что эти оборонительные сооружения потеряли свое значение, а также то, что форштадт, который находился перед крепостью, в начале века частично был заселен стрелками, местная киевская власть с конца XVIII в. начала активно раздавать эти земельные участки под застройку (в том числе и территорию между крепостью и Печерской горой и вообще вокруг крепости).