Одним из важнейших направлений деятельности МЦР стало издание научно-философского, литературного и художественного наследия семьи Рерихов. Эта работа велась в тесном сотрудничестве с Отделом рукописей, занимавшимся обработкой уникального архива. Людмила Васильевна является автором вступительных статей к книгам, появление которых стало настоящим событием в культурно-духовной жизни России: дневниковым записям Е.И.Рерих, вошедшим в книгу «У порога Нового Мира» (выдержавшую несколько переизданий в формате «Малой рериховской библиотеки» и «Большой рериховской библиотеки»), трехтомнику очерков Н.К.Рериха «Листы дневника» и его книге «Шамбала», каталогу Музея, многочисленным сборникам из серии «Малая рериховская библиотека» и др. Эти работы по праву считаются классикой рериховедения. В них поставлены и освещены наиболее сложные проблемы мировоззрения и творчества наших соотечественников, раскрывается значение их деятельности для человечества. На примере своих работ Людмила Васильевна показывает нам, что такое методология, в которой учитывается духовный аспект. Без принятия существования иных миров, взаимодействующих между собой, и высокоразвитых существ, способных влиять на эволюционные процессы, без принятия концепции человека как главного инструмента эволюции, носителя духа, тонких структур, подступаться к исследованию жизни и деятельности таких выдающихся людей, как Рерихи, бессмысленно.

С 2003 года по инициативе Людмилы Васильевны начался выпуск нового научного издания Учения Живой Этики с обширным текстологическим комментарием, основанном на сравнительном анализе имевшихся в распоряжении МЦР источников. Серию книг предваряла ее большая вступительная статья «Философия космической реальности», осмысливающая место Живой Этики в пространстве современной философской мысли и написанная специально для этого издания. В статье давалось систематическое изложение космических законов, действующих на всех уровнях мироздания, и убедительно доказывалось, что в Живой Этике содержится новая научная методология и новая система познания, а сама она является энергоэволюционным импульсом Высшего. Под общей редакцией Л.В.Шапошниковой и с большой вступительной ее статьей был выпущен научный каталог Музея имени Н.К.Рериха в двух томах, содержащий подробные сведения и комментарии о живописных произведениях и рисунках всех четырех Рерихов, включая историю бытования картин, их поступления в коллекцию.

Людмила Васильевна выступила в качестве составителя и инициатора целого ряда научных изданий, возглавив редакционную коллегию как серий («Рериховская научно-популярная библиотека», «Труды Объединенного Научного Центра проблем космического мышления», «Справочник по рериховедению», «Защитим имя и наследие Рерихов»), так и отдельных сборников. Это участие никогда не было формальным: она внимательно изучала материалы, отправляла их на доработку, делала критические замечания, консультировала авторов. По сути, это было полноценное научное редактирование и даже больше – демонстрация подхода к предмету исследования на личном примере, поощрение авторов к всесторонней и глубокой разработке затронутых ими проблем.

И, конечно же, особое место среди изданий МЦР занимают труды самой Людмилы Васильевны, посвященные проблемам нового космического мировоззрения. Блистательный писательский талант, обширные познания и пытливый ум философа позволили ей создать целый ряд выдающихся произведений, помогающих читателю осмыслить важнейшие положения Живой Этики и стимулирующих его собственные размышления о происходящем на нашей планете. В своем последнем интервью на вопрос «Что лично Вы привнесли в понимание философии Рерихов?» она ответила: «Мне кажется, ничего я не привнесла. Но написала так, что многие сложные вещи стали понятны каждому человеку. Ведь Рерихов читать очень непросто»