Через четыре дня Дзержинский пишет Манцеву о том, что «Украина теперь важнее, чем когда-либо. Определенно создается новая кампания против нас, двинут Румынию и других для создания фронта на всем юге – от Румынии до Грузии включительно». Поэтому в Украину в течение недели прибудет с Кубани 20–30 батальонов. Председатель ВЧК рекомендует Манцеву «заняться организацией тыла, связаться с фронтом и держать постоянную связь с Москвой».

В 1920 году на органы госбезопасности Украины были возложены дополнительные обязанности по охране государственных границ с Румынией, Польшей, на Черном и Азовском морях. С этого времени начинается усиленное формирование пограничных частей ВУЧК, объединенных в Украинскую пограничную дивизию. Сотрудникам ВУЧК приходилось не только охранять государственную границу от различных враждебных происков и нарушений, но и вести напряженную борьбу с контрабандой.

В 1921 году в центре внимания украинских чекистов было не только усиление охраны границы, а, как и ранее, проведение операций по раскрытию и пресечению антисоветских заговоров на Украине, разгрому банд, разоблачению агентуры спецслужб противника, ликвидации диверсионных и террористических групп на Украине. При этом важнейшее внимание уделялось борьбе с польским шпионажем и петлюровцами, которые проявляли большую активность в районе Киева и в правобережной Украине. 19 января 1921 года Дзержинский писал Манцеву о том, что «польская разведка на Правобережье работает великолепно. Сведения у нее точные и быстро получаемы».

Особого накала достигла борьба с петлюровцами. ЦК КП(б) Украины 24 июня 1921 года вынес специальное решение: предложить ВУЧК продолжить со всей энергией борьбу с петлюровщиной, мобилизовать на помощь коммунистов из других силовых органов. Это распоряжение свидетельствовало о крайней ожесточенности борьбы всех политических сил и участников Гражданской войны, из которой Россия и Украина вышли с тяжелым наследием: только в 1920 году органами ЧК Украины было расстреляно 3879 человек. И действия многих органов на местах подтвердили слова председателя ВУЧК Лациса: «Чрезвычайные комиссии все время старались так поставить работу и так отрекомендовать себя, чтобы одно напоминание о комиссии отбило всякую охоту саботажников вымогать и устраивать заговоры, но чтобы всякий честный гражданин видел в них защиту своих прав и завоеваний Октябрьской революции».

В области карательной политики партийные органы Украины требовали соблюдать дифференцированный классовый подход, осторожность в применении принудительных мер к трудящимся. Пятая конференция КП(б) Украины подчеркивала, что меры наказания за бандитизм и крестьянские восстания должны строжайшим образом согласовываться с классовой политикой, строжайшей законностью, не допуская ущемления прав человека. Недопустимы репрессии по отношению к селянству в целом. Требовалось освободить тех, кто выступал против советской власти «вследствие малой сознательности». На VIII съезде РКП(б) Ленин говорил, что «главный урок – быть чрезвычайно осторожным в нашем отношении к среднему крестьянству и мелкой буржуазии… От нас потребуется частая перемена линии поведения… Мы вовсе не желаем употреблять насилие. Наш враг – буржуазия, и, когда она выступает против, к ней применяются меры пролетарской дисциплины».

Объясняя применение расстрелов в годы Гражданской войны, Дзержинский на приветствие делегатов IV Всероссийской конференции ЧК по случаю награждения его орденом Красного Знамени ответил: «И точно так же, как раньше, мы со спокойной совестью убивали врагов, потому что иначе их было нельзя победить. Точно так же мы теперь должны приняться за другие методы, с такой же энергией и таким же чистым сердцем».