Создание структуры таможенного ведомства в составе Министерства финансов диктовалось потребностью дальнейшего совершенствования органов государственного управления российской империи, ростом экономики страны и ее внешнеэкономическими связями. Департаменту таможенных сборов подчинялись Таможенная, Пограничная и Корчемная стражи.
Первый таможенный флаг был утвержден в 1827 году. Его прообразом стал военно-морской (Андреевский) флаг. Изменен был только и винтовки со штыком. Из-за необходимости выразить многоступенчатую подчиненность Пограничной стражи на флаге образовалась довольно сложная композиция, включавшая изображение российского коммерческого флага, государственную символику в виде герба и собственно эмблему Пограничной стражи.
В связи с возрастанием значения Санкт-Петербургского порта и ростом грузооборота в 1832 г. было возведено здание Санкт-Петербургской портовой таможни. Над ним был поднят российский таможенный флаг. Начало развития железнодорожного сообщения как основного вида сухопутных грузоперевозок вызвало необходимость строительства Московской складочной таможни. Комплекс таможенных зданий был построен в 1853 г.
Ко времени октябрьской революции таможенное дело в России регулировалось таможенным уставом 1910 года. Руководил таможенным делом департамент таможенных сборов, созданный в 1864 году. Данный департамент находился в плохом состоянии, таможенная система была разрушена. Большинство таможен было закрыто, а служащие эвакуированы. В 1917 году на съезде служащих был образован центральный комитет профсоюзов таможенных работников. Была объявлена государственная монополия на внешнюю торговлю.
По сути государство заблокировало всю систему таможенно-тарифного регулирования, а таможенный контроль стал элементом при внешней торговле от лица государства. Первым актом в области таможенного дела стал декрет от 29 декабря 1917 года о разрешении на ввоз и вывоз товаров. Данным декретом устанавливалась государственная монополия на внешнюю торговлю. В период с 1917-1921 г.г. таможенным пошлинам отводилась огромная роль. Товары распространялись, а не продавались.
С переходом к Новой Экономической Политике начала развиваться внешняя торговля. Было предоставлено право выхода на мировой рынок, что привило к восстановлению таможенного дела и регулирования.
В это время в западной Европе царил кризис, наступивший в результате I мировой войны. Капиталистическим странам приходилось искать новые рынки для сбыта товаров. Одним из рынков была Россия. Англия и Франция после долгих колебаний решили пригласить Советское государство на Генуэзскую конференцию, которая была в Генуе в 1922 году. На конференции была приглашена и Германия, США не стали участвовать, но и препятствовали её созыву.
Данная конференция продолжалась 5 недель и привела к неожиданным событиям. Советская делегация на данной конференции предложила признать Россию де-юре, представить кредиты и внесла предложение о всеобщем разоружении. Советская власть не отошла от своих принципов и не позволила себе что-то навязать. Предложение о разоружении заинтересовала многих других зарубежных стран. Первое соглашение было заключено между Советской Россией и Германией. В нем говорилось о дипломатических отношениях, об аннулировании претензий и экономических связей. Подписание данного договора стало переломным моментом. Советское государство добилось признания своего права на внешнюю торговлю и установлении при каждом представительстве торговое представительство.
В 1922 году вышел декрет о внешней торговли, где было указанно, что все товары подлежали обложению таможенной пошлины, которая устанавливалась советом народных комиссаров и не менялись. Европейские государства, несмотря на подписанное соглашение, начали активно выступать против государственной монополии и торговли в России. Деловые круги образовали золотую блокаду. Банки США отказывались принимать золото за оплату товаров, а так же установили указ на ввоз леса