Генеральный прокурор в соответствии с ФЗ «О прокуратуре РФ» имеет право участвовать в заседаниях Верховного суда РФ и Высшего арбитражного суда РФ. Кроме того, Генеральный прокурор наделен правом обращения в Конституционный суд РФ в случаях, когда примененный в конкретном деле закон нарушает конституционные права и свободы граждан.

Также Генеральный прокурор имеет, в соответствии с ФЗ «О прокуратуре РФ», полномочие обращаться в Пленум Верховного суда РФ и в Пленум Высшего Арбитражного суда РФ, подавая туда представления о даче разъяснений судами по вопросам, относящимся к сфере судебной практики по уголовным, гражданским, административным, арбитражным делам.

ФЗ «О прокуратуре РФ» определяет следующие полномочия (права и обязанности) прокурора. Прокурор обладает правом: 1) принимать участие в судебном рассмотрении дел; 2) осуществлять уголовное преследование в суде (в процессе судопроизводства прокурор может отказаться от обвинения, если его позиция в отношении виновности подсудимых изменилась); 3) выступать в суде в качестве государственного обвинителя; 4) обращаться в суд с заявлением (например, о признании незаконными и потому недействительными правовых актов должностных лиц, о защите материальных и других интересов групп населения, юридических или физических лиц); 5) вступать в дело на любом этапе судебного процесса, когда это диктуется необходимостью защитить права граждан и интересы государства и общества; 6) обращаться в вышестоящий суд с протестом или обжалованием решения, определения, постановления или приговора суда, не вступившего в законную силу и признанного необоснованным или незаконным; 7) опротестовывать решение, определение, постановление или приговор суда, вступившие в законную силу.

Реализация последних двух полномочий может значительно различаться по форме, условиям и основаниям применения. Это зависит от того, каким именно законодательством – уголовно-процессуальным, гражданским процессуальным или арбитражно-процессуальным – это полномочие регламентируется в каждом конкретном деле. Особыми полномочиями обладает Генеральный прокурор: 1) принимать участие в заседаниях Верховного суда РФ, Высшего арбитражного суда РФ; 2) в случае нарушения или возникновения возможности нарушения конституционных прав граждан примененным законом – обращаться в Конституционный суд РФ; 3) обращаться в Пленум Верховного суда РФ и в Пленум Высшего Арбитражного суда РФ, подавая туда представления о даче разъяснений судами по вопросам, относящимся к сфере судебной практики по уголовным, гражданским, административным, арбитражным делам.

В целях соблюдения принципа независимости прокурорской деятельности Федеральный закон «О прокуратуре РФ» утверждает недопустимость вмешательства в осуществление прокурорского надзора (ст. 5):

«1. Воздействие в какой-либо форме федеральных органов государственной власти, органов государственной власти субъектов Российской Федерации, органов местного самоуправления, общественных объединений, средств массовой информации, их представителей, а также должностных лиц на прокурора или следователя с целью повлиять на принимаемое им решение или воспрепятствование в какой-либо форме его деятельности влечет за собой установленную законом ответственность.

2. Прокурор и следователь не обязаны давать каких-либо объяснений по существу находящихся в их производстве дел и материалов, а также предоставлять их кому бы то ни было для ознакомления иначе как в случаях и порядке, предусмотренных федеральным законодательством. (Этот пункт Постановлением Конституционного суда РФ от 18 февраля 2000 г. признан не соответствующим Конституции РФ постольку, поскольку он влечет за собой отказ органов прокуратуры предоставлять гражданину для ознакомления материалы, которые непосредственно затрагивают его права и свободы, несмотря на то, что законом не предусмотрены надлежащие основания для этого, связанные с содержанием указанных материалов. В то же время этот пункт не противоречит Конституции РФ постольку, поскольку он освобождает прокурора и следователя от обязанности давать какие-либо объяснения по существу находящихся в их производстве дел и материалов, а также предоставлять их кому бы то ни было для ознакомления, и тем самым является гарантией от недопустимого вмешательства в деятельность органов прокуратуры.)