К полномочиям Совета Федерации отнесено назначение Генерального прокурора РФ и его заместителей. Председатель Совета Федерации приводит к присяге лицо, назначенное на должность Генерального прокурора РФ.

Генеральный прокурор РФ ежегодно представляет палатам Федерального Собрания РФ доклад о состоянии законности и правопорядка в Российской Федерации и о проделанной работе по их укреплению. Государственная Дума и Совет Федерации осуществляют парламентский контроль деятельности прокуратуры посредством заслушивания на своих заседаниях докладов и отчетов Генерального прокурора РФ, депутатских расследований.

Органы прокуратуры по запросам и обращениям депутатов парламента проводят проверки сообщений о фактах нарушений законов, принимают меры по их устранению и сообщают парламентариям об их результатах.

Приведенные выше аргументы позволяют утверждать о подотчетности Генерального прокурора Президенту РФ и Федеральному Собранию РФ. Генеральный прокурор РФ, его заместители и по их поручению другие прокуроры вправе присутствовать на заседаниях палат Федерального Собрания РФ, их комитетов и комиссий, представительных (законодательных) органов субъектов Российской Федерации и органов местного самоуправления.

Прокуратура не является субъектом законодательной инициативы, но в докладе парламентариям может содержаться информация о недостатках законодательного регулирования отдельных сфер правовых отношений, а также предложения о мерах законодательного характера, направленных на совершенствование их правового регулирования, анализ действующего законодательства, отмечаются пробелы в законодательстве, выявленные прокурорской практикой. Прокуратура привлекается к обсуждению поступающих на рассмотрение Государственной Думы законопроектов, вносит по ним предложения, замечания и отзывы, проводит экспертизу законопроектов, представители прокуратуры принимают участие в рабочих группах комитетов Государственной Думы по подготовке законопроектов, участвуют в парламентских слушаниях.

Федеральное Собрание РФ принимает закон о федеральном бюджете, в котором предусмотрены соответствующие объемы финансирования органов прокуратуры на очередной финансовый год.

Прокуратура и исполнительная власть. Прокуратура не входит в систему органов исполнительной власти, но осуществляет надзор за исполнением законов федеральными министерствами, государственными комитетами, службами и иными федеральными органами исполнительной власти, органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации.

Прокуратура взаимодействует с исполнительной властью в различных сферах, в том числе посредством участия в правительственных программах, инициирования принятия Правительством РФ постановлений, затрагивающих права и свободы граждан, интересы государства и общества.

Не осуществляя надзора за законностью постановлений и распоряжений Правительства в случае выявления несоответствия их Конституции РФ и законам Российской Федерации, Генеральный прокурор информирует об этом Президента РФ.

Прокуратура и судебная власть. В соответствии с ч. 6 ст. 35 ФЗ «О прокуратуре Российской Федерации» Генеральный прокурор РФ вправе обращаться в Конституционный Суд РФ по вопросу нарушения конституционных прав и свобод граждан законом, примененным или подлежащим применению в конкретном деле. Приведенная норма основана на положениях ч. 4 ст. 125 Конституцией РФ, относящей к ведению Конституционного Суда РФ рассмотрение такого вида нарушений в порядке, установленном федеральным законом.

Вместе с тем, в ФКЗ «О Конституционном Суде Российской Федерации» прокурор как субъект обращения в Конституционный Суд не обозначен (ст. 3), в ней присутствует только суд.