Яицкое казачество свои права на земли по правому и левому берегам Яика отстаивало с XVII в., т. е. со времени получения грамоты от царя Михаила Федоровича. Он «принял их под свою державу, пожаловал им грамоту на приуральские земли, реку Яик со всеми при ней угодьями до устьев включительно и со всеми впадающими в нее реками и выходящими из нее рукавами и разливами»[35]. Эта грамота была утеряна в результате пожара[36], и ее содержание удается выяснить, анализируя переписку казачества с русским правительством в XVIII–XIX вв. Фактически Петербург признал грамоту Михаила Федоровича: «Права эти… подтверждаются у казаков, почему уральцы и надеются, что земли, усвоенные России предками нынешнего поколения, ими заселены, оберегаемыя и которыя они считают неотделимою собственностью, останутся в их владении»[37].
Целая серия правительственных актов закрепляла черту владений казачества по р. Урал, а следовательно, и определяла западные пределы казахских земель. В 1721 г. яицкие казаки обратились к русскому правительству с просьбой о возобновлении грамоты царя Михаила Федоровича, надеясь с ее помощью запретить крестьянам Самарской губернии и башкирам пользоваться рыбными угодьями по р. Яик. Правительствующий Сенат 28 октября 1732 г. издал указ «Военной, Иностранной и Комерц-коллегиям, Казанской и Астраханской губерниям не допускать башкир и низовых городов жителей ловить рыбу по Яику-реке, в озерах, ярках и протоках, где яицкие казаки рыбные ловли имеют»[38].
Яицкие казаки ранее других районов освоили земли при впадении в Урал рек Сакмара, Илек и Чаган, т. е. места, богатые пахотными землями и лугами. В начале XVIII в. здесь проживало более 3 тыс. казаков. С увеличением народонаселения казаки поселились по левому берегу р. Чаган, а также по рекам Большой и Малый Узень, Чиж, и до конца XVIII в. с севера и северо-запада их начали теснить казенные крестьяне. Тогда казаки в 1796 г. просили Государственную военную коллегию об обмежевании их земель, что и было сделано в соответствии с распоряжением Правительствующего Сената специальной комиссией во главе с генерал-майором А. А. Черкасовым.
Народам Казахстана и Средней Азии предстояли новые битвы за Семиречье с джунгарами (ойратами или калмыками).
Во второй половине XVI в. джунгары начали воевать с казахами. Последние же производили успешные набеги на земли узбеков и, овладев Туркестаном и Ташкентом, даже достигали Самарканда и Бухары в 1598 г.
Джунгары начали вытеснять из Семиречья казахов и киргизов. Туркестан и Ташкент оставались под властью казахов до 1723 г.
Джунгары, продвигаясь на запад, опустошили Хорезм и достигли берегов Волги. В 1655 г. часть джунгар с Галдан-Бошокту-ханом продолжили войны с казахами, киргизами и Ферганой, утвердили свою власть в Семиречье.
Хунтайджи Цеван-Рабтан разбил войско казахов и отнял у них Сайрам, Ташкент, Туркестан в 1723 г., а сын его Галдан-Церен захватил в 1741 г. земли Среднего казахского жуза, население которого частично находилось в российском подданстве.
В 1758 г. джунгары были уничтожены войсками Китайской империи, в общей сложности погибло до миллиона человек.