Противоречиво определяются перечни субъектов государственного и муниципального секторов экономики. В соответствии с п. 1. Постановления Правительства РФ от 04.01.1999 № 1 «О прогнозе развития государственного сектора экономики Российской Федерации» к хозяйствующим субъектам государственного сектора относятся: государственные унитарные предприятия, в том числе казенные; государственные учреждения; хозяйственные общества, в уставном капитале которых более 50 % акций (долей) находятся в государственной собственности; хозяйственные общества, в уставном капитале которых более 50 % акций (долей) находятся в собственности хозяйственных обществ, относящихся к государственному сектору экономики.

Однако в государственном секторе экономики могут действовать не только хозяйствующие субъекты, но и иные организации. Статья 3 Федерального закона от 06.12.2011 № 402-ФЗ «О бухгалтерском учете» к организациям государственного сектора относит государственные (муниципальные) учреждения, государственные академии наук, государственные органы, органы местного самоуправления, органы управления государственных внебюджетных фондов, органы управления территориальных государственных внебюджетных фондов. Встречается и более узкое понимание круга субъектов государственного сектора. Так, Правительство РФ в п. 6 Приложения 1 к Стратегии инновационного развития Российской Федерации на период до 2020 г., утвержденного распоряжением от 08.12.2011 № 2227-р, перечисляя основные направления реализации этой Стратегии, относит к субъектам государственного сектора компании с государственным участием и государственные корпорации. При этом понятие «компании с государственным участием» не раскрывается.

В судебных актах понятия государственного и муниципального секторов используются для различных целей. В некоторых случаях принадлежность стороны к государственному или муниципальному сектору предусматривает применение к ним специальных норм права.

Так, по делу об обжаловании решения Управления Федеральной монопольной службы, которым ФГУП «Государственная корпорация по организации воздушного движения в РФ» в лице филиала «Аэронавигация Дальнего Востока» признана нарушившей законодательство о защите конкуренции в части совершения действий по установлению и применению платы за оказание услуги аэронавигационного обслуживания. Ссылку Госкорпорации и Росавиации на Руководство по экономическим аспектам аэронавигационного обслуживания, ИКАО Doc 9161/3 (далее – Руководство), согласно которому организация – поставщик таких услуг вправе не только предоставлять все виды аэронавигационного обслуживания, но и оказывать связанные с ним услуги на основании договоров гражданско-правового характера, суд отклонил, исходя из следующего. Пунктом 2.13 названного документа предусмотрено: «Организация предоставляет все виды аэронавигационного обслуживания и может также оказывать связанные с ним услуги, например, по координации поисково-спасательных работ. Как правило, она несет ответственность за регулирование в области безопасности полетов авиации». Пунктом 2.11 Руководства предусмотрено, что имеются три основные или ключевые формы организации деятельности по обеспечению аэронавигационного обслуживания на национальном уровне: правительственный департамент, автономная организация государственного сектора и организация частного сектора. Пункт 2.13 расположен в разделе, касающемся организации деятельности правительственного департамента. Суд счел, что ФГУП обладает признаками формы организации аэронавигационного обслуживания, предусмотренной подпунктом «b» пункта 2.11 Руководства: «автономная организация государственного сектора, не находящаяся под непосредственным руководством правительства, однако правительство имеет полное право собственности на эту организацию». Таким образом, пункт 2.13 Руководства не подлежит применению к рассматриваемым правоотношениям