Порядок управления фондом и порядок формирования его органов определяются его уставом, утверждаемым учредителями. Устав фонда помимо общих для всех видов юридических лиц сведений должен содержать: наименование фонда, включающее слово «фонд»; сведения о целях фонда; указания об органах, в том числе о попечительском совете, осуществляющем надзор за деятельностью фонда; порядок назначения должностных лиц фонда и их освобождения; указание на место нахождения фонда; описание судьбы имущества фонда в случае его ликвидации.

Важное положение, касающееся внесения изменений в устав фонда и его ликвидации, закреплено в ст. 119 ГК РФ. Органы фонда могут принять решение об изменении его устава, если такая возможность прямо предусмотрена в уставе его учредителями, а основания ликвидации фонда определены исчерпывающим образом. Если возможность внесения изменений в устав не предусмотрена учредительными документами, то такое право предоставлено только суду.

Благотворительная или иная общественная деятельность фондов нуждается в постоянных материальных затратах, которые невозможно финансировать в отсутствие членских взносов (как и в общественных организациях), ибо фонд не имеет фиксированного членства. Поэтому гражданское законодательство разрешает фондам, как и другим некоммерческим юридическим лицам, участвовать в предпринимательской деятельности непосредственно или через создаваемые для этих целей хозяйственные общества.

Предпринимательская деятельность фонда должна соответствовать общественно полезным целям, т. е. его основным уставным задачам, носить строго целевой характер, соответствующий его специальной правоспособности, и подвергаться тем же ограничениям, что и участие в имущественном обороте общественных и религиозных организаций.

Учреждения представляют собой разнообразные виды некоммерческих организаций: органы государственного и муниципального управления, учреждения образования и просвещения, культуры и спорта, социальной защиты, основанных на государственной и муниципальной собственности, а также частные учреждения, созданные и финансируемые юридическими или физическими лицами – собственниками.

Учреждение – единственный вид некоммерческой организации, не являющейся собственником своего имущества (оно закреплено за учреждением на праве оперативного управления (ст. 296 ГК РФ)). Оно представляет собой «остатки» прежней экономической системы, что, в принципе, не свойственно развитому товарному обороту.

Опасность участия в гражданском обороте таких юридических лиц для третьих лиц смягчается правилом о дополнительной (субсидиарной) ответственности финансирующего их собственника по их долговым обязательствам. Данное положение неоднократно подтверждалось материалами судебной практики (например, см. постановление ФАС Волго-Вятского округа от 28 августа 2008 г. по делу № А43-26483/2007-8-697, на основании которого иск о взыскании задолженности по оплате работ, выполненных для муниципального учреждения, правомерно удовлетворен за счет казны муниципального образования, являющегося собственником данного имущества).

С учетом этого закон не определяет даже наименования учредительных документов этих организаций: это может быть как устав, таки общее положение об организациях данного вида либо положение о конкретной организации, утвержденное ее собственником. С учетом многообразия видов учреждений ГК РФ допускает регламентацию их правового статуса, как специальными законами, так и подзаконными актами, которые могут определять их статус.

Учреждение может быть реорганизовано или ликвидировано по воле собственника либо по решению суда в случаях, предусмотренных законом. В отношении государственных и муниципальных учреждений решение принимает уполномоченный собственником орган государственного управления либо орган местного самоуправления. Преобразование государственного или муниципального учреждения в коммерческую или некоммерческую организацию иной формы собственности допускается лишь в рамках законодательства о приватизации.