В июльские дни Троцкий решительно выступал против развернутой в небольшевистской печати травли Ленина как «германского шпиона». В это время Ленин вместе с Зиновьевым скрывался в финском Разливе, что только усиливало подозрения.
Спекуляции на эту тему продолжаются по сей день. Ленин – не вождь Октябрьской революции, не руководитель первого в мире социалистического государства, как бы к нему ни относиться, а банальный «германский шпион». В своих воспоминаниях Троцкий, исследуя доказательства Керенского о причастности Ленина к «шпионскому делу», пишет следующее: «Керенский ссылается, правда, на мемуары Людендорфа. Но из этих мемуаров явствует лишь одно: Людендорф надеялся, что революция в России приведет к разложению царской армии – сперва февральская революция, затем октябрьская. Чтобы разоблачить этот план Людендорфа, не нужны были его мемуары. Достаточно было того факта, что группа русских революционеров была пропущена через Германию. Со стороны Людендорфа это была авантюра, вытекающая из тяжкого военного положения Германии. Ленин воспользовался расчетами Людендорфа, имея при этом свой расчет. Людендорф говорил себе: Ленин опрокинет патриотов, а потом я задушу Ленина и его друзей. Ленин говорил себе: я поеду в вагоне Людендорфа, а за услугу расплачусь с ним по-своему.
Что два противоположных плана пересеклись в одной точке и что этой точкой был «пломбированный» вагон, для доказательств этого не нужно сыскных талантов Керенского. Это исторический факт. После того история уже успела проверить оба расчета. 7 ноября 1917 г. большевики овладели властью. Ровно через год под могущественным влиянием русской революции немецкие революционные массы опрокинули Людендорфа и его хозяев…».
Троцкий скрываться не собирался. Он был арестован и помещен в «Кресты». В тюрьме он успел написать и переправить на волю две брошюры: «Что же дальше? (Итоги и перспективы)» и «Когда же конец проклятой бойне?». Первая брошюра заканчивалась словами: «Перманентная революция против перманентной бойни! Такова борьба, в которой ставкой является судьба человечества». Пребывание в «Крестах» было недолгим, и уже 2 сентября Временное правительство вынуждено было освободить Троцкого и всех социал-демократов, арестованных в июльские дни. К этому времени мятеж генерала Корнилова был уже подавлен, и авторитет большевиков, активно выступивших против Корнилова, резко возрос. Это подтвердили муниципальные выборы, проведенные в обеих столицах.
Стараясь вырвать у большевиков инициативу, меньшевики и эсеры предложили провести Всероссийское демократическое совещание, с целью попытаться подменить им необходимость проведения II съезда Советов и создать в стране видимость парламентского строя. Совещание открылось 14 сентября. Троцкий выступал за бойкот созданного Предпарламента, но его предложение не было принято. Однако позже ЦК РСДРП(б) приняло решение об уходе большевистской фракции из Предпарламента.
25 сентября (8 октября) состоялись перевыборы Исполкома Петроградского Совета. Большинство в новом исполкоме впервые оказалось за большевиками, и по предложению большевистской фракции председателем Петросовета был избран Троцкий. Рост влияния РСДРП(б) в осенний период отмечался по всей России, и на повестку дня вновь был выдвинут лозунг «Вся власть Советам». С этого же времени начинается подготовка к восстанию.
Личный вклад Троцкого в организацию большевистского переворота оценил не кто иной, как сам Сталин в статье «Октябрьский переворот», опубликованной в газете «Правда» 6 ноября 1918 года. В статье Троцкий представлен как главный организатор и руководитель восстания, а Н… Подвойский и В. А. Антонов-Овсеенко – лишь исполнителями его воли. Однако по мере того, как менялся со временем сам Сталин, менялись и его оценки роли Троцкого. В 1924 году в речи Сталина «Троцкизм или Ленинизм» вклад Троцкого выглядел уже скромнее, а в «Кратком курсе истории ВКП(б), 1938 г., который стал настольной книгой для многих поколений коммунистов, о роли Троцкого в октябрьских событиях говорилось только в отрицательных тонах. Идейная борьба Сталина против «троцкизма», начатая в 1924 году сразу после смерти Ленина, закончилась решительной и «окончательной» победой Сталина в 1940 году в свойственном ему стиле – ударом ледоруба по голове Троцкого. Что же было в действительности в этот предреволюционный период – можно представить в хронологическом порядке после избрания Троцкого председателем Петросовета.