Следует подчеркнуть, что введение института военных комиссаров было временной, чрезвычайной мерой, оно не означало принципиального отказа от единоначалия как наиболее целесообразного принципа руководства и управления войсками и силами флота. Институт военных комиссаров не преследовал цели контроля за действиями командиров, не вызывался недоверием к ним. Основное в деятельности военных комиссаров периода Великой Отечественной войны – это помощь командирам в решении боевых задач. В сравнении с функциями заместителя командира по политической части комиссар имел больше прав, но и нес большую ответственность.

Указом Президиума Верховного Совета СССР «Об установлении полного единоначалия и упразднении института военных комиссаров в Красной Армии» от 9 октября 1942 г. институт комиссаров был заменен институтом заместителей командиров по политической части[3].

В соответствии с этим Указом Президиума Верховного Совета СССР 9 октября 1942 г. был издан приказ народного комиссара обороны СССР № 307 «Об установлении полного единоначалия и упразднении института военных комиссаров в Красной Армии». На командиров (начальников) целиком возлагалась ответственность за все стороны жизни и деятельности частей, соединений и учреждений Красной Армии. В соединениях, частях, штабах, подразделениях, военно-учебных заведениях, центральных и главных управлениях комиссариата обороны и учреждениях Красной Армии вводился институт заместителей командиров по политчасти. Для политработников устанавливались общие для всех командиров воинские звания и знаки различия.

Заместители по политической части не имели комиссарских полномочий, их функции ограничивались политической работой среди личного состава. В большинстве своем после замены должностей комиссары частей и соединений автоматически стали заместителями по политической части. Тем из них, кто имел воинские звания политсостава, были присвоены общевойсковые воинские звания (как правило, по занимаемой на момент переаттестации должности обычно на ступень ниже штатного звания соответствующего командира). Вместе с тем должности членов военных советов фронтов и армий сохранялись.

В настоящее время происходят переоценка и переосмысление истории Советского государства. К тематике функционирования института военных комиссаров сегодня обращаются многие исследователи отечественной военной истории. Однако и на сегодняшний день, несмотря на имеющиеся разрозненные диссертационные исследования и публикации, тема создания и функционирования этого института, его места и роли в жизнедеятельности вооруженных сил нашей страны является недостаточно разработанной.

Исследование такой многоплановой темы позволяет глубже понять роль военных комиссаров в создании массовой регулярной Красной Армии, в достижении победы в Гражданской войне и в совершении перелома в Великой Отечественной войне.

Следует подчеркнуть, что в связи с нынешней большой доступностью источниковой базы отечественных исторических архивов меняются и сами методологические подходы, идет фактически коренное переосмысление опыта и уроков Гражданской и Великой Отечественной войн. За последние десятилетия в исторической науке идут процессы преодоления существовавшей в недалеком прошлом идеологической однотипности и схематизма. Больше внимания в настоящее время уделяется малоизученным проблемам и «белым пятнам» в военной исторической науке. Появляются новые трактовки исторических событий, однако в то же время имеются и новые искажения исторических событий. Некоторые публикации последних лет откровенно выполняют определенный социально-политический заказ, опираются на сомнительную источниковую базу.