Триде Юмтен (справа) и Намде Осунг (слева)

Трицук Децен был убит антибуддийским министром в 838 году, и его брат Ланг Дарма впоследствии был возведен на трон. Новый Ценпо объявил о запрете буддизма в 843 году, стал казнить религиозных лидеров, заставлял монахов отказываться от религиозного сана, закрывая монастыри и уничтожая статуи Будды и священные писания. В истории этот период получил название «Преследование буддизма Ланг Дармой». Вопреки ожиданиям Ценпо, такой запрет не смог смягчить социальные конфликты. Наоборот, он спровоцировал огромное количество восстаний монахов. В 846 году монах Лхалунгом Пелгьи Дордже убил Лан Дар-му стрелой из лука.

Два сына Лан Дармы, Триде Юмтен и Намде Осунг, боролись за трон при поддержке разных министров. Войны между военными на границе длились более 20 лет. В 869 году подданые и рабы восстали против правящей верхушки. Восемь лет спустя повстанческая армия разрушила мавзолеи Ценпо, убила членов царской семьи и дворян. Царство Тубо в итоге распалось.

Поскольку в 869–1239 годах на Цинхай-Тибетском нагорье не существовало единого государства, историки назвали этот период Эпохой раздробленности. Триде Юмтен и его потомки сначала контролировали Лхасу и Самье, а Намде Осунг занимал Шань-нань. Войны между ними длились много лет. После того, как в 905 году Намде Осунг был отравлен собственными вассалами, его сын Палхорцан бежал в Шигадзе, где начал строить замки и крепости. Но в 923 году в Гяндзе Палхорцана убили восставшие жители. Его старший сын Таши Цепапал продолжал защищать город. Кидэ Ньима Гон, второй сын, бежал в Пуранг из Нгари и, женившись на дочери одного из местных дворян, вступил в альянс с тамошней знатью. Три сына Кидэ Ньима Гона обосновались в Ладакхе, Пуранге и Гуге, позднее основав королевства Ладакх и Гуге. Тем временем тибетские племена в бассейнах рек Хуанхэ в Цинхае, воспользовавшись упадком династии Тан, приветствовали потомка Ценпо в качестве своего нового лидера, и на этой территории воцарился режим Гьялсе. Однако попытки потомков Ценпо возродить царство Тубо успеха не имели, царство окончательно пришло в упадок. Некоторое время они боролись на ограниченной части нагорья, но вскоре их вытеснили новые лидеры.

Местные вожди, происходившие либо из новых кланов, либо из потомков знати Тубо, превращались в лордов феодальных владений. После распада царства Тубо и уничтожения клановой системы появились независимые фермеры и пастухи. Однако практически все они были либо захвачены в плен во время войн, либо обанкротились из-за долгов, либо примкнули к религиозным или политическим лидерам в поисках защиты. Феодальное крепостничество постепенно начало обретать форму на всей территории Тибета.

В эпоху раздробленности в Тибете возродился буддизм. Луме Шераб Тшултрим основал миссию в Лхасе в 949 году, положив начало Второму распространению буддизма в Тибете. Во время подавления буддизма Лан Дармой три монаха – Цан Рабсал, Йо Гэйюн и Дмар Сакья Мунэ – бежали в монастырь Даньтиг в уезде Хуалун провинции Цинхай. В 894 году они взяли на обучение местного ученика Лачена Гонгпа Рабсала (в др. источниках – Генпа Рабсэл). Ввиду недостаточного количества монахов для проведения церемонии посвящения были приглашены два ханьских монаха. Так центр буддизма постепенно формировался в бассейнах реки Хуан-хэ в Цинхае. Вождь Самье Еше Гьялцен, потомок Тридэ Юмтена в шестом поколении, в 936 году послал Люме Шераба Тшултрима и еще девять человек для посвящения в ученики к Лачену Гонгпе Рабсалу. После своего возвращения они начали пропагандировать буддийские учения, набирать учеников, строить новые монастыри и восстанавливать старые, а также основали множество буддийских миссий. Это время известно в истории как «Распространение буддизма из Восточного Тибета». Вскоре после этого Джангчуб Еше-О, правитель царства Гуге, построил несколько монастырей, а также отправил группу юношей в Индию изучать буддизм. Лотсава Ринчен Сангпо, один из них, ездил в Индию трижды. В бытность настоятелем монастыря Толин он перевел множество индийских буддийских текстов на тибетский язык, наставлял учеников и постепенно пропагандировал буддизм. Этот период известен как «Распространение буддизма из Индии».