В первые месяцы Иниго переживал глубокое «духовное утешение». Утешением он называет внутренний мир, покой, радость, глубокий и наполняющий опыт молитвы. Иногда у него было видение некой «красивой вещи», похожей на змею. При этом видении он испытывал удовольствие. Ему не нравилось, когда она исчезала. В последствии он пишет, что до этого времени «он постоянно находился почти в одном и том же состоянии духа, испытывая весьма стойкую радость, ничего не ведая о вещах «внутренних», духовных» (РП 20). Столь резким приговором он критически оценивает этот период своего духовного развития: утешение был лишь внешним и ложным утешением.

Затем последовал второй период, время тяжелой внутренней борьбы, сильных искушений и «оставленности», под которой он понимал внутреннюю пустоту, скуку, одиночество, своего рода глухоту души, отчаяние или депрессивное настроение и фрустрацию. Эти состояния совпали у Иниго с периодом массивных «сомнений и угрызений совести», субъективно воображаемых грехов, которые объективно таковыми не являются, но вызывают сильные угрызения совести и чувство вины. Вначале Иниго страдал от сильных и необъяснимых для него перепадов настроения (РП 21). Мотивация вести новую жизнь пропадала, он чувствовал нежелание продолжать начатую жизнь, отвергал свой образ жизни. Сомнения привели к тому, что он поставил под сомнение полноту, а следовательно и действительность своей генеральной исповеди на Монтессерате. Он вновь и вновь исповедовался в тех же самых грехах. Но это было не в состоянии облегчить его совесть. Ему не помогали ни духовники, ни строгие упражнения покаяния, ни духовные советы. В конце концов он решил полностью отказаться от еды, до тех пор пока он не получит исцеления. Духовник приказал ему не искушать Бога таким образом. Иниго даже почувствовал в себе желание броситься в отверстие в полу. Это искушение покончить жизнь самоубийством он преодолел лишь благодаря тому, что считал самоубийство смертным грехом, а следовательно недозволенным поступком.

После долгих мучений он выбрался из этой западни, чуть было не ставшей для него смертельной, внезапно почувствовав в себе отвращение к своему прежнему образу жизни. Он «как бы проснулся ото сна» (РП 25) и тотчас же ясно почувствовал, что он больше уже не хочет исповедовать прежних грехов. В Рассказе паломника он пишет: «он считал вполне очевидным, что это наш Господь пожелал освободить его по милосердию Своему» (РП 25). Эта внезапная перемена не имеет естественного или психологического объяснения. Игнатию, оглядываясь назад в конце жизни, остается лишь с удивлением осознавать, что вероятно это Сам Бог прямо вмешался в его жизнь, в один момент изменив ее. Он с помощью собственных усилий хотел «сделаться» святым. Однако его моральный и аскетический ригоризм привел его лишь к глубокой ненависти к самому себе и развил в нем саморазрушительные импульсы. Лишь открытие, что Бог уже давно простил ему все его прошлые грехи по Своему милосердию и благодати, вывело его этого духовного тупика.

После этого очередного поворота во внутренней жизни начался третий период его духовного пути. Иниго начал снова есть мясо и ухаживать за своим телом. Это был внешний знак его внутреннего отказа от нездорового ригоризма. Он стал спокойнее и переживал время великих утешений. В Рассказе паломника он подробно описывает пять даров благодати, которым он позже придавал огромное значение. Вначале он упоминает о видении Трех Божественных Лиц: Отца, Сына и Святого Духа, то есть Божественной Троицы. Он чувствовал благоговение пред Ней и испытывал при этом утешение и радость. В течение всей его жизни тринитарное измерение оставалось значимым для его духовности (РП 28). Последующие видения Творения и Евхаристии также являются краеугольными камнями его духовности. Видение Человечества Христа показывает, что для Игнатия, как и для всей испанской мистической традиции, путь к Богу лежит исключительно через отношения с Человеком Иисусом (РП 29). В части II,4 нашей книге мы еще подробно вернемся к данной теме.