Когда вооруженных дворян «для защиты царей» собралось достаточно много, царевна Софья вызвала из Москвы к себе начальника Стрелецкого приказа князя Ивана Хованского с сыном Андреем. Их схватили по пути и казнили в селе Воздвиженском по обвинению в связях с раскольниками-старообрядцами. В тот же день, 17 сентября (день именин Софьи), головы были отрублены и у 37 сподвижников Хованских. Двух других сыновей князя – Петра и Ивана отправили в ссылку.

Казнь вожаков привела московских стрельцов в шоковое состояние. Опомнившись, они укрылись за кремлевскими стенами, решив дать бой боярам. Но сила теперь была не на их стороне. Вокруг Москвы, перекрыв дороги к ней, с полками дворянского конного ополчения стояли бояре и воеводы князья Андрей Голицын и Петр Урусов, Алексей Шеин и Иван Волынский.

В начале ноября 1682 года правительница Софья Алексеевна с царями вернулась из Троицы в столицу. Ее сопровождали многочисленные дворянские отряды. Теперь уже она от имени Ивана V и Петра I стала диктовать свою волю стрельцам. Для начала срыли на Красной площади «столп», а полкам запретили собираться «кругом». Главой Стрелецкого приказа был назначен Федор Шакловитый, который становится правой рукой царевны, а впоследствии и ее фаворитом.

Начинается чистка стрелецкого гарнизона Москвы. В первопрестольном граде остаются только семь самых надежных полков. Остальные рассылаются для несения гарнизонной службы в порубежные города. На их место с окраин государства призываются пять полков городовых стрельцов, ранее располагавшихся на далеких окраинах (из городов Украинных).

Так начиналось семилетнее правление Русским царством Софьи Алексеевны. После того как были утихомирены столичные стрельцы и учинена расправа над раскольниками, на первый план стали выходить внешнеполитические проблемы. Последовало подписание «вечного мира» с Речью Посполитой без всяких ей территориальных уступок. Глава Посольского приказа князь В.В. Голицын рассчитал все верно: польский король Ян Собеский очень нуждался в союзниках для продолжения войны с Османской империей. Потому он и признал за своей подписью «вечное право» России на Киев, Левобережную Украину и Смоленск.

Подписание «вечного мира» означало, что Русское царство (его в Европе называли Московией) вступало в «Священную лигу» – военный союз Польши, Австрии и Венеции против Турции. Москва обязывалась начать военные действия против султанского вассала – Крымского ханства. Тем самым в идущей войне отвлекалась от польских и австрийских владений крымская конница. Но, готовя поход на Крым, Россия тем самым защищала собственные пределы на юге, подвергавшиеся частым разбойным набегам крымских татар.

Петр I стал свидетелем того, как военная сила царства готовилась, таяла и возвращалась ни с чем из двух Крымских походов. Первый из них состоялся в 1687 году. В мае месяце, пока степные травы еще не успели выгореть, 100-тысячная армия с 350 пушками под командованием большого воеводы князя Василия Голицына выступила в поход на Крым. Войска сопровождали огромные обозы. Но уже в июне поход пришлось прекратить еще на далеких подступах к Перекопу. Едва ли не главной причиной стали степные пожары, вызвавшие бескормицу для десятков тысяч лошадей, и отсутствие питьевой воды. В русском стане погибло много людей. Из-за массового падежа лошадей пришлось бросить обозы.

В умышленном поджоге степи обвинение пало на малороссийского гетмана Самойловича, который не желал похода на Крым, боясь усиления Москвы. Корыстолюбивого и непопулярного среди украинского казачества гетмана низложили и вместе с сыном отправили по этапам в Сибирь. Новым гетманом Левобережной Украины стал Иван Мазепа, личный враг Самойловича. Пройдет время, и он станет «потаенным» врагом петровской России.