Церковь Девы Марии (Фрауэнкирхе) на Рыночной площади Нюрнберга13

В 1415 году бургграф Фридрих VI стал курфюрстом Бранденбурга, а в 1420 году в ходе конфликта с находившемся в союзе с городом герцогом Людвигом VII Баварским, наместник герцога сжёг замок бургграфа. Фридрих VI в 1427 продал городу свой замок, владения в бургграфстве и феодальные права, но в 1449—1453 гг. в ходе «Первой маркграфской войны» сын Фридриха маркграф Альбрехт Ахилл Бранденбург-Ансбахский попытался силой вернуть обратно семейные владения и штурмовал Нюрнберг войском в 7 тысяч человек. Не сумев взять город, Альбрехт Ахилл сжёг много сёл вокруг города.

В Позднее Средневековье Нюрнберг стал большим торговым центром на маршруте из Италии к Северной Европе и одним из важнейших имперских городов в Священной Римской империи. Его развитию весьма способствовало предоставление ему в 1332 году императором Людвигом Баварским освобождения от таможенных платежей в 70-ти городах империи. Благодаря цветущей международной торговле и ремёслам в XV и XVI веке Нюрнберг стал одним из значительных культурных центров эпохи Возрождения к северу от Альп, а также гуманизма и Реформации.

В эпоху протестантской Реформации в 1524 году город относительно спокойно принял лютеранство. Тогда лютеранское движение охватило широкие массы населения Нюрнберга, и перепуганный Совет города вынужден был законодательно провозгласить Нюрнберг лютеранским городом.

23 июля 1532 года в Нюрнберге между императором-католиком Карлом V и протестантскими князьями во главе с курфюрстом Саксонским был заключен «Первый религиозный мир». В 1538 году в городе был оформлен союз Карла V с католическими князьями против протестантов.

Во время «Второй маркграфской войны» 1552—1554 гг. маркграф Альбрехт Алкивиад Бранденбург-Кульмбахский напал на Нюрнберг, но не сумев его взять осадой, опустошил окрестности. Огромные военные расходы Нюрнберга в размере 4 млн. гульденов положили конец его экономическому подъему. Однако окончательно период упадка наступил в результате «Тридцатилетней войны» 1618—1648 гг. В 1632 году город, занятый войсками шведского короля Густава Адольфа, осаждался имперской армией Альбрехта фон Валленштайна. Постои имперских и шведских войск, финансовые затраты на откуп от неприятелей, прекращение торговли превратили сохранявший нейтралитет Нюрнберг в должника и привели к сокращению населения. Экономическому упадку Нюрнберга в XVII—XVIII вв. также способствовало перемещение основных путей международной торговли на просторы Мирового океана.

Негативно на развитии города в XVII—XVIII вв. сказывалось сохранявшееся со времён Средневековья общественное устройство Нюрнберга с господством патрициата в управлении городом. Так, если в XV веке городской Совет состоял из 26 членов, представлявших 28 патрицианских семей, то в XVIII веке – из 34, представлявших 19 семей. Под руководством патрициата город так сильно залез в долги, что его задолженность составила громадную для того времени сумму в 9 923 580 гульденов.

Большие перемены для Нюрнберга наступили в конце XVIII – начале XIX века. В 1791 году часть его земель была оккупирована Баварией, а в 1795 году другая часть – Пруссией, сократив его до территории собственно города. В 1794 году под давлением Имперского надворного совета («Reichshofrat») патрициат провёл конституционную реформу, допустившую, наконец, буржуазию Нюрнберга до управления городом.

9 августа 1796 года французская революционная армия генерала Жан-Батиста Журдана заняла Нюрнберг, но вынуждена была уйти после поражения от австрийского эрцгерцога Карла в «Битве при Амберге» 24 августа 1796 года.