Разразился грандиозный политический скандал, приведший к отставке президента Никсона. Тогдашний директор ЦРУ Шлезингер издал секретную директиву, согласно которой всем сотрудникам конторы предлагалось сообщать о деяниях сослуживцев, «могущих выходить за рамки мандата ЦРУ». В результате того, что сослуживцы начали стучать друг на друга, появилось досье под кодовым названием «Сокровища короны». Потом, по указанию госсекретаря Генри Киссинджера, досье пополнять перестали и отправили в архив.
И вот к 60-летию ЦРУ были рассекречены документы, касающиеся работы этой организации в 1950–1970-е годы. ЦРУ оказалось причастным к убийству премьер-министра Конго Патриса Лумумбы и к ликвидации президента Доминиканской республики Рафаэля Трухильо. Стало известно о существовании тайных тюрем ЦРУ. Из этих документов мир узнал также, что ЦРУ грубо нарушало запрет на деятельность внутри страны. Работники конторы проводили секретные психологические опыты, шпионили за журналистами и людьми левых взглядов, нарушали право на неприкосновенность жилища и тайну переписки, подслушивали телефонные разговоры. В 1979 году ЦРУ не смогло спрогнозировать исламскую революцию в Иране. Следом выяснилось, что Ирану тайно продавалось американское оружие, а на вырученные деньги оказывалась, несмотря на запрет конгресса, помощь никарагуанским повстанцам, действовавшим против просоветского правительства Даниеля Ортеги.
Несмотря на все эти скандалы, конгресс и президент Рейган приняли решение о финансировании крупной операции по вооружению моджахедов Афганистана, воевавших против СССР. В 1981 году Рейган издал приказ 12333, запрещающий ЦРУ прямо или косвенно участвовать в убийствах. Однако после терактов 1 1 сентября 2001 года президент Джордж Буш-младший заявил, что на террористов не распространяются нормы и правила войны. Это предоставило ЦРУ возможность свободы действий для осуществления физической ликвидации, подготовки переворотов, созданию и обучению иностранных вооруженных формирований. Кроме «ликвидаций», спецслужбы США начали применять метод «чрезвычайной доставки». Этот метод заключается в похищении из различных стран Европы мусульман, подозреваемых в терроризме. Поскольку американское законодательство запрещает применение пыток, похищенных для допроса доставляли в исламские государства, являющиеся союзниками США. Для временного содержания выкраденных людей использовались тайные тюрьмы ЦРУ в европейских странах.
Эта практика применялась до тех пор, пока в 2005 году в Италии не разразился скандал в связи с похищением проживавшего там египтянина. Дело о тайных тюрьмах ЦРУ дошло до Европарламента.
ЦРУ вынуждено было признаться в проведении 70 спецопераций «чрезвычайной доставки». В том же году специальная комиссия по оценке эффективности разведки США в своем докладе президенту указала на нехватку у ЦРУ нелегальных агентов за рубежом. И в этом вопросе, как отмечалось в докладе, ЦРУ не проявляет должной гибкости и индивидуального подхода. В ЦРУ существует очень жесткий отбор кандидатов для приема на работу. И значительная часть тех, кого на работу не приняли, были американцами арабского происхождения в первом поколении. Но именно такой контингент мог быть полезен в работе, т. к. эти люди знают не только язык, но и традиции тех стран, откуда они приехали, сохранили там много родственников.
После этого ограничения на прием «арабоамериканцев» были сняты, но жесткие методы проверок сохранились. В 2005 году президент Буш приказал ЦРУ в течение 5 лет увеличить вдвое задействованный в тайных операциях персонал и персонал аналитиков. И работают эти агенты не только в арабских странах, но и на постсоветском пространстве. В 2008 году КГБ Белоруссии пресек деятельность более 10 агентов спецслужб иностранных государств. В российской армии за 2007–2008 годы выявлено 6 человек, собиравших разведывательную информацию для зарубежных спецслужб. За тот же период пресечена шпионская деятельность 16 иностранцев, раскрыты новые методы разведывательной деятельности и предметы шпионской экипировки зарубежных спецслужб.