Тем не менее, стоит отметить, что переговоры в Эрфурте были менее сердечными, чем в Тильзите. Так, в частности, во время одного очень резкого спора, когда царь отказался действовать против Австрии, Наполеон со злости швырнул на землю свою шляпу (двууголку) и пнул её в сторону. Однако Александр, ничуть не смутившись, сказал ему: «Вы вспыльчивы. Я же – упрям. Гневом от меня Вы ничего не добьётесь. Давайте разговаривать, рассуждать, иначе я уеду».34
Таким образом, в результате Эрфуртской союзной конвенции атмосфера недоверия, существовавшая между Францией и Россией ещё перед Эрфуртом, не только не рассеялась, но даже сгустилась. Франко-русский союз дал первую серьёзную трещину, за которой последовали дальнейшие расхождения, приведшие в конечном итоге к полному разрыву отношений и войне 1812 года.
В ноябре 1808 года Наполеон мобилизовал примерно 165 000 солдат и двинулся с этими силами в Испанию. Он нанёс ряд поражений испанцам и англичанам, и уже 4 декабря 1808 года вступил в Мадрид. Англия потеряла свой экспедиционный корпус. Тогда, чтобы остановить Наполеона была срочно создана новая, Пятая антинаполеоновская коалиция, в которую вошли Австрия, Великобритания и Испания, представленная временным правительством – верховной хунтой.
10 апреля 1809 года австрийцы вторглись в Баварию, Италию и герцогство Варшавское. Первое большое сражение произошло при Абенсберге в Баварии. Австрийцы были разбиты, потеряв при этом больше 12 тысяч человек. Вторая битва произошла при Экмюле 22 апреля. Она кончилась новой победой Наполеона. Эрцгерцог Карл Людвиг Иоанн был отброшен за Дунай, понеся тяжкие потери. Затем маршал Ланн, завершая маневр, приступом взял Регенсбург. Наполеоновской армии удалось разделить австрийскую армию на две части: одна отступила в Чехию, другая – за реку Инн. Французы вошли в Австрию и 13 мая заняли Вену.
Решающее сражение этой войны произошло 5—6 июля 1809 года в районе села Ваграм, северо-восточнее Вены. В ходе этого сражения австрийцы встретили французов сильным ружейным огнём. Но французы, захватив левый фланг австрийцев, начали развивать успешное наступление в центре, хотя несли очень большие потери. Эрцгерцог Карл, увидев, что французы подтягивают свои резервы, и что Нейзидельские высоты, за которые разгорелись упорные бои, австрийцы взять не смогут, в 3 часа дня дал приказ к отступлению. Австрийская армия потерпела поражение, потеряв убитыми, ранеными и пленными около 38 тысяч человек. Французские потери были также велики – около 34 тысяч человек.
Таким образом, в сражениях 1809 года Наполеон разбил войска эрцгерцога Карла, завершив тем самым существование Пятой коалиции.
12 июня 1809 года было заключено австро-французское перемирие. А 14 октября 1809 года австрийский император Франц II заключил с Наполеоном Шёнбруннский мир, по которому Австрия лишалась выхода к Адриатическому морю; уступала Франции часть Каринтии и Хорватии, Крайну, Истрию, Триест и Фиуме, составившие Иллирийские провинции; Баварии – Зальцбург и часть Верхней Австрии; герцогству Варшавскому – Западную Галицию. Россия за участие в войне против Австрии на стороне Франции получила Тарнопольский округ.