Весь 1808 год прошёл в бездействии и переговорах. Россия начала войну со Швецией, а в Турции произошёл очередной переворот, в ходе которого Мустафа IV был низложен, а султаном провозглашён Махмуд II.

В Эрфурте в период с 27 сентября по 14 октября 1808 года прошли переговоры между Александром I и Наполеоном. Их результатом стало подписание союзного договора между Россией и Францией. При этом Наполеон, в ущерб интересам Турции, чтобы заручиться поддержкой России в блокаде Англии и назревающем конфликте с Австрией, согласился на приобретение Россией Молдавии и Валахии.

После этих переговоров Александр I повелел Прозоровскому вступить в переговоры непосредственно с Мустафой-пашой рущукским, ставшим великим визирем, и требовать от него уступки Молдавии и Валахии, а также протектората России над Сербией. Визирь уже было согласился на эти чрезвычайно выгодные для России условия, но в ноябре 1808 года был убит янычарами. Тем временем Англия и Австрия, ставшие врагами России после союза Александра с Наполеоном, убедили нового султана отвергнуть русские требования, и война продолжилась.

22 марта 1809 года русские войска под командованием Прозоровского возобновили боевые действия против турок, о чём незамедлительно был извещён сербский вождь Карагеоргий. Сербы предприняли наступление сразу по четырём направлениям: на востоке – на Видин, на юго-востоке – на Ниш, на западе – на Боснию и на юго-западе – на Стари-Влах. Первоначально сербам сопутствовал успех, но затем пошли неудачи. Так, в мае 1809 года сербское войско, направлявшееся в Ниш, потерпело поражение на горе Чегар у села Каменица, а в июле 1809 года сербы были разбиты у селения Делиград. Таким образом, дорога на Белград оказалась открытой. Только благодаря успешным действиям русских войск, предпринявших в октябре 1809 года решительное наступление, османские войска были отброшены обратно к Нишу. С июля по октябрь 1810 года сербам совместно с русскими войсками удалось восстановить контроль над всеми территориями, которые находились в их власти до поражений 1809 года. С 6 по 12 января 1811 года в Белграде состоялась скупщина старейшин, на которой было объявлено о верховной наследственной власти Карагеоргия, и образовано правительство из 6 попечителей (министров).

После смерти в августе 1809 года Прозоровского главнокомандующим Дунайской армией стал генерал Пётр Иванович Багратион, который успешно руководил боевыми действиями на левом берегу Дуная. Войска Багратиона овладели крепостями Мачин, Гирсово, Кюстенджа, разгромили у Рассавета 12-тысячный корпус отборных турецких войск и нанесли крупное поражение туркам под Татарицей. В феврале 1810 года вместо Багратиона главнокомандующим был назначен генерал от инфантерии Николай Михайлович Каменский, отличившийся в войне против Швеции и заслуживший от командующего Финляндской армией и генерал-губернатора Финляндии Барклая-де-Толли репутацию «искуснейшего генерала». Русские войска под командованием Каменского взяли турецкие крепости Силистрия, Разград, Базарджик (Добрич), но при этом потерпели неудачу при штурме Шумлы и Рущука.

26 августа 1810 года русские войска одержали блистательную победу над турками в сражении при Батине. Осенью того же года были взяты турецкие крепости Рущук и Никополь. Однако 4 февраля 1811 года Каменский заболел тяжёлой изнурительной лихорадкой. 12 марта, передав командование генералу Ланжерону, он отправился в Одессу. По пути он лишился слуха, у него обнаружились признаки умственного расстройства, и 4 мая 1811 года он умер. После этого война с Турцией зашла в тупик, а внешнеполитическая обстановка требовала быстрых эффективных действий. И Александр I назначил главнокомандующим Дунайской армией генерала Михаила Илларионовича Голенищева-Кутузова.