Итак, военные действия в этой русско-турецкой войне разворачивались следующим образом. В середине ноября 1806 года русские войска перешли Днестр. Коменданты крепостей Хотин, Бендеры, Аккерман и Килия не стали оказывать сопротивления русским и уступили их без боя. Однако паша, возглавлявший гарнизон в Измаиле, не поддался уговорам Михельсона, заверявшего, что русские войска вступили в Дунайские княжества лишь для спасения Турции от честолюбивых замыслов Наполеона. В то же время рущукский комендант Алемдар Мустафа-паша выслал сильный отряд к Бухаресту, заняв который, турки стали предаваться всяческим насилиям над местными жителями. Но длилось это недолго. 13 декабря 1806 года подошедший корпус генерала Милорадовича разромил турок и освободил от них Бухарест. Турки затем попытались вернуть Бухарест, но в 1807 году Милородович вновь нанёс им поражения в битвах при Турбате и Обилешти. После этого турки окончательно отказались от наступления на Бухарест, и отошли за Дунай.

Военная кампания 1807 года характеризовалась напряжёнными боями вблизи отдельных крепостей на Дунае, превращённых турками в мощные опорные пункты своей обороны. В феврале – марте 1807 года русские войска генерала Мейендорфа осадили и пытались взять Измаил, но их действия успеха не имели. Между тем Михельсон, расположив свои войска на зимних квартирах в Дунайских княжествах, вступил в союз с сербами, восставшими ещё в 1804 году против османского владычества.

Формирование турецкой армии шло крайне медленно, но русским не суждено было воспользоваться этим шансом из-за продолжавшейся войны с Наполеоном в Восточной Пруссии. Поэтому в начале 1807 года Михельсону было приказано упор делать только на оборону. Наступательные действия возлагались на Черноморский флот и балтийскую эскадру адмирала Дмитрия Николаевича Сенявина, крейсировавшую в Средиземном море в рамках Второй Архипелагской экспедиции, а также на русские войска, дислоцированные в Грузии. При этом следует отметить, что адмиралу Сенявину в 1807 году удалось разгромить турецкий флот в Дарданелльском и Афонском сражениях. Тем временем 17 июня 1807 года русский отряд численностью до 1000 человек переправился на правый берег Дуная, соединился с сербами и начал осаду крепости Неготин.

25 июня (8 июля) 1807 года Россия заключила с Французской империей Тильзитский мир, по которому она обязалась прекратить военные действия на Балканах. Вследствие этого 2 августа 1807 года было заключено с Османской империей Слободзейское перемирие. По условиям этого перемирия русские в течение 35 дней обязывались покинуть Дунайские княжества, возвратить остров Тенедос и захваченные у турок корабли. Турки же, сохранив всё ещё державшиеся крепости Измаил, Браилов и Журжу, обязывались не входить в княжества и прекратить военные действия в Сербии. Но император Александр I был крайне недоволен этим перемирием, шедшим вразрез с целью войны (приобретением Молдавии и Валахии), и приказал остановить начавшуюся уже эвакуацию войск из Дунайских княжеств. Состав Дунайской армии был удвоен прибытием из Польши четырёх дивизий и доведён до 80000 человек. Главнокомандующим русской армии вместо генерала Мейендорфа был назначен ветеран елизаветинских войн генерал-фельдмаршал Александр Александрович Прозоровский.

Осенью 1807 года в обстановке перемирия турецкий султан Мустафа IV предпринял попытку урегулировать отношения с сербами, предоставив им желанную автономию. Весной 1808 года сербы вступили в переговоры с властями Австрийской империи, но они закончились безрезультатно. В конце ноября 1808 года в селе Топола Карагеоргий был объявлен верховным правителем Сербии с наследственной властью.