В ограде храма, где до революции находился некрополь духовенства и прихожан, в 1961 г. был погребен Воронежский и Липецкий митрополит Иосиф.

17 сентября 1989 г. в Покровский собор из антирелигиозного музея были торжественно перенесены мощи свт. Митрофана. В Покровском соборе они находились до освящения нового Благовещенского кафедрального собора.

Градский Троицкий Смоленский собор. Троицкий Смоленский собор не дошел до наших дней. О его первом предшественнике даже сведений не сохранилось. Известно, что в 1779 г. по инициативе Воронежского епископа Тихона III, началось строительство новой Троицкой церкви. В 1781 г. в ней был освящен придел Смоленской иконы Божией Матери. В 1789 г. почти достроенная церковь обрушилась. Возобновленное на руинах строительство завершилось к 1822 г. При соборе была возведена трехъярусная колокольня.

В 1836 г., когда при Благовещенском соборе был учрежден Митрофанов монастырь, штат Благовещенского собора был переведен в Троицкий собор, который с этого времени стал носить статус кафедрального.

По габаритам, величию, великолепию новой отделки и богатству утвари Троицкий собор был первым в Воронеже. В нем находилась чтимая Богородичная икона из ризницы епископа Митрофана.

Жертвовательницами собора были графиня А. Орлова-Чесменская и купчиха Александра Андронова, сестра поэта А. Кольцова. Прихожанами собора была семья поэта И.С. Никитина. А Троицком соборе был крещен писатель А. Платонов, а в церковно-приходской школе при соборе он учился.

Троицкий собор был ограблен властями в ходе компании по изъятию церковных ценностей. В 1920-х гг. его захватили обновленцы. Здесь служили лжемитрополиты, а на «пастырских» курсах обновленцы готовили свои кадры. Верные Патриарху Тихону священнослужители лишились своих мест. Протоиерей Павел Устиновокий был арестован и погиб в лагере.

В 1932 г. собор был закрыт, а в конце 1950-х гг. разрушен.

Владимирский собор. Собор был основан в 1888 г., в память девятисотлетия принятия Русью христианства и посвящен св. равноапостольному князю Владимиру. Первый камень в фундамент собора был заложен только в 1896 г.

Проект собора разработал губернский архитектор А.А. Кюи, старший брат композитора Цезаря Кюи.

Для строительства храма был создан особый комитет, куда вошли городской голова И.В. Титов, купец Н.А. Клочков. Городской архитектор А.М. Баранов принимал в работе комитета самое деятельное участие.

Средства на строительство жертвовали Митрофанов монастырь, купец Н.И. Зубов, духовенство епархии и сами горожане, среди которых был пущен «кружечный сбор».

Вчерне строительство собора завершилось в 1909 г., а в следующем году состоялось первое богослужение в храме.

За годы строительства скончались радетели храма городской голова И.В. Титов и купец Н.А. Клочков. После освящения собора один за другим ушли архитекторы А.А. Кюи, А.М. Баранов, епископ Анастасий (Добрадин).

Оставшиеся предреволюционные годы продолжалась внутренняя отделка собора. 27 апреля 1918 г., в Лазареву субботу, архиепископ Тихон IV (Никаноров) освятил Владимирский собор.

Собор имел два придела: св. блгв. кн. Александра Невского, при котором произошло прославление св. Владимира, и свв. Кирилла и Мефодия, создателей славянского алфавита.

Богослужения во Владимирском соборе проходили до 1930 г. В этом году собор был закрыт, а в следующем снесен.

Вознесенская церковь. Свою историю Вознесенской церковь ведет от деревянной церкви Рождества Христова с приделом страстотерпца Георгия, освященной в 1739 г. Тот храм стоял ниже, в остроге, на взгорье к реке. Он погиб в пожаре 1748 г., и вместо него была построена новая деревянная церковь, на другом месте, и освящена во имя Вознесения. В 1754–1757 гг. церковь была перестроена в камне, и освящена в мае 1757 г. В 1770 г. появился придел во имя Ахтырской иконы Божией Матери, а в 1776 г. – во имя вмч. Варвары.