К концу 1922 г. были закрыты Архангельская, крестовая и трапезная церкви монастыря. При Благовещенском соборе была учреждена кафедра обновленческого митрополита Корнилия (Попова). Тем временем настоящий предстоятель Воронежской епархии служил в Акатовом монастыре.
В августе 1929 г., когда на поклонение мощам свт. Митрофана пришло большое число паломников-крестьян со всей губернии, власти стали требовать изъятия святых мощей и полной ликвидации монастыря. В первую неделю января 1930 г. мощи свт. Митрофана были изъяты и переданы в музей. Мероприятия по изъятию св. мощей переросли в стихийный митинг, потребовавший снятия колоколов со всех церквей Воронежа. В конце января все колокола монастырской звонницы были сняты, включая и 440-пудовый бас, и отданы в переплавку. Собор был разграблен. Один мастер за тысячу рублей согласился срезать крест с колокольни главного храма Воронежа, но после того, как он это сделал, этот человек сошел с ума. Окончательно монастырь был разрушен в годы Великой Отечественной войны, в 1942–1943 гг. В последствии на его месте был построен главный корпус Воронежского университета.
В 1998-2009-х гг. в центре Воронежа, по благословению Патриарха Московского и Всея Руси Алексия II, был возведен новый храм, освященный во имя Благовещения. В настоящее время он является кафедральным собором епархии. Здесь же пребывают честные мощи свт. Митрофана Воронежского.
Благовещенский собор в Воронеже Фотограф Алексей Москалев
Покровский кафедральный собор. Кафедральный собор Воронежа, один из красивейших храмов города. Ведет свою историю от деревянной клецкой церкви, упомянутой в 1615 г., в слободе Беломестных атаманов. В то время в церкви служили священники Григорий Степанов и Иван Федоров, проскурницей была некая Ульяна.
В начале XVIII в., по благословению свт. Митрофана, ветхая церковь была заменена новой, а в 1736 г. она была перестроена в камень. В 1748 г. добавлена Сретенским приделом, а 11 февраля 1796 г. епископ Мефодий (Смирнов) освятил второй придел во имя иконы Божией Матери «Знамение».
В 1791–1792 гг. при храме была возведена трехъярусная колокольня. Документы упоминают ее строителя каменных дел мастера Михаила Спиридоновича Турчанинова. На колокольню подняли пять колоколов. Самый большой колокол был привезен из Москвы.
В 1814–1820 гг. в Покровской церкви служил диаконом Спиридон Шимкевич, покинувший родной Могилев при нашествии французов. Его сын Федор учившийся во Владимирской духовной семинарии, впоследствии стал известным Филологом, составителем «Корнеслова».
В 1823–1824 гг. по прошению прихожан и с благословения епископа Епифаний (Канивецкого), был расширен придел церкви. План работ составил прихожанин Т.С. Кондратьев.
В 1833–1841 гг., по благословению архиепископа Антония, была осуществлена перестройка основного объема храма. Проект, вероятно, был выполнен губернским архитектором И.А. Блицыным. Храм был освящен архиепископом Антонием 14 июля 1841 г. В конце 1840-х гг. были освящены теплые приделы во имя Сретения Господня и иконы Божией Матери «Знамение».
Впоследствии, церковь подвергалась некоторым перестройкам и последний раз была освящена 25 сентября 1893 г.
В 1920-х гг. Покровская церковь лишилась своих ценностей, впрочем, ценность представлял только хранившейся в ней серебряный ковш, дарованный неизвестному донскому казаку в царствование императрица Анны Ивановны.
Во второй половине 1920-х гг. Покровскую церковь захватили обновленцы и сделали ее своим кафедральным собором. Священники церкви Петр Новосельцев и Павел Пашин были репрессированы, а Павел Смирнский в 1937 г. расстрелян. В 1930-х гг. в храме находился антирелигиозный музей, во время Великой Отечественной войны – квартиры, а после войны храм был передан верующим и стал кафедральным собором епархии.