Танкисты под командованием гвардии полковника Бойко проявили отличие и в Берлинской стратегической наступательной операции. В ходе операции соединения 8-й гвардейской армии генерал-полковника В.И. Чуйкова встретили упорное сопротивление противника на Зееловских высотах. Поэтому командующий 1-м Белорусским фронтом Маршал Советского Союза Г.К. Жуков был вынужден ввести в сражение 1-ю и 2-ю гвардейские танковые армии, которые втянулись в упорные бои и не смогли оторваться от пехоты. Лишь к исходу 17 апреля 1945 г. бригадам 11-го гвардейского танкового корпуса гвардии полковника А.Х. Бабаджаняна во взаимодействии со стрелковыми частями удалось завершить прорыв второй полосы и продвинуться в глубь вражеской обороны. Командующий 1-й гвардейской танковой армией генерал-полковник танковых войск Катуков решил в эту брешь ввести главные силы 8-го гвардейского механизированного корпуса, 64-ю гвардейскую танковую бригаду и ряд отдельных частей. «Но враг принял срочные контрмеры, – вспоминал Катуков. – С левого фланга он перебросил свежие силы. Бабаджанян оказался в трудном положении: ему приходилось не только наносить фронтальные удары, но и отражать контратаки противника с левого фланга. Тогда я усилил бригаду И.Н. Бойко ствольной артиллерией и дивизионом PC и поручил ему отразить удары пехоты и танков врага с левого фланга. Я не сомневался, что такой волевой и находчивый командир, как Бойко, справится с этой задачей. И действительно, комбриг надежно прикрыл фланг Бабаджаняна и сорвал фашистскую контратаку».

30 апреля 1945 г. командующий 1-й гвардейской танковой армией представил гвардии полковника Бойко к награждению орденом Суворова 2-й степени. «В Берлинской операции 1 гвардейской танковой армии командиру 64 гвардейской танковой бригады гвардии полковнику тов. БОЙКО была поставлена задача обеспечить открытый фланг армии, против которого противник выставил крупные силы танков и пехоты, – говорилось в наградном листе. – В течение 19, 20 и 21 апреля 1945 г. противник неоднократно обрушивал свои силы на фланг армии, надеясь фланговым ударом сорвать наступление армии на БЕРЛИН. Тов. БОЙКО смелыми и энергичными действиями бригады каждый раз отбрасывал противника, нанося ему большие потери, до тех пор, пока противник не прекратил попыток осуществления своего плана. На протяжении этой операции бригада тов. Бойко нанесла следующий урон противнику: солдат и офицеров – 1500, танков и самоходных орудий – 23, орудий разных калибров – 31, пулеметов – 10 и др. вооружение противника». Этим орденом Иван Никифорович был награжден 31 мая 1945 г.

– Помните, товарищи, что в воздухе надо чувствовать локоть друга.

Такими словами М.З. Бондаренко напутствовал летчиков-штурмовиков, которым было приказано нанести удар по вражескому аэродрому севернее Орла, где базировалось около 100 самолетов.

Это «чувство локтя» Бондаренко впоследствии объяснял так:

– Когда идешь в строю, думаешь о тех, кто с тобой рядом, стараешься не отбиться от них, пытаешься правильно угадать по малейшему покачиванию крыла, какой маневр изберет командир, чтобы тут же повторить его, как бы трудно ни было, – это и есть «слетанность».

В Великую Отечественную войну М.З. Бондаренко вступил, имея уже боевой опыт, полученный в войне с Финляндией. В составе 198-го штурмового авиационного полка он с сентября 1941 г. прикрывал дальние подступы к Москве на волоколамском участке Западного фронта. «Задерживая наступление гитлеровцев, – писал командир полка майор В.И. Туровцев, – Михаил Бондаренко показал себя отважным и мужественным летчиком. В сложных метеорологических условиях он выводил группу на цель, внезапными атаками штурмовал автоколонны, танки, автоцистерны с горючим, уничтожал вражескую пехоту».