Кроме того, в XVI в. формируется система классификации дипломатов наподобие системы дипломатических рангов. Существовали такие ранги, как великий посол, легкий посол, посланник, посланный, посланец и гонец. Отдельно стояли переводчики письменные и устные – толмачи. За рубеж обычно направляли великих послов, легких послов, посланников и гонцов.

Продолжал складываться дипломатический церемониал. Так, обряд заключения договора просуществовал до правления Петра Первого и выглядел следующим образом: договор скрепляли присягой, целованием креста, после чего было необходимо приложить печать.

В первые годы правления Ивана IV внешняя политика России была обращена в первую очередь на восток, где было необходимо обезопасить границы и установить окончательный контроль над территорией находившейся в упадке Золотой Орды, которая находилась в упадке. в 1552 г. к России была присоединена Казань, в 1556 г. – Астрахань, и присоединение поволжских земель к Москве окончательно ликвидировало угрозу с востока. На западе основной задачей стало приобретение выхода к Балтийскому морю для укрепления внешнеторговых связей, что фактически вылилось в Ливонскую войну 1558–1583 гг., один из крупнейших конфликтов в Европе того времени. Тогда же формируется Посольский приказ.

Первым главой нового органа стал подьячий ИВАН МИХАЙЛОВИЧ ВИСКОВАТЫЙ, для которого задача первостепенной важности заключалась в налаживании связей с Западной Европой, в первую очередь с Англией. Итогом переговоров стало заключение торгового соглашения между двумя странами. Висковатый выступил за начало Ливонской войны 1558–1583 гг. и на Земском соборе 1566 г. предлагал пойти на компромисс с Польшей и заключить перемирие без претензий на все земли Ливонии, что, однако, не было одобрено участниками собора. Опасения Ивана Михайловича оправдались, и в 1569 г. Польша и Литва по Люблинской Унии объединились в одно государство, Речь Посполитую, что резко подорвало позиции России в Восточной Европе. В 1570 г. Висковатого обвинили в измене и казнили, однако его детище продолжало жить. С 1667 г. на пост главы Посольского Приказа вместо думного дьяка утверждались думные бояре, а посольские дьяки получали боярские чины.

После разорительной и неудачной Ливонской войны Россия вступает в эпоху политического и общественного кризиса: в 1598 г. обрывается династия Рюриковичей, наступает период Смуты (1601–1613 гг.), за время которой Московское государство смогло отразить польско-шведскую интервенцию. В это время внешнеполитическая деятельность оказалась в руках быстро сменявшими друг друга правительств: так, в 1605–1606 гг. Лжедмитрий I, пришедший к власти при участии польских авантюристов, проводил политику, подрывающую суверенитет Москвы. Интересам государства также противоречили активные контакты с папским престолом, стремившимся с помощью самозванца-правителя обратить Россию в католичество. В период противостояния Василия Шуйского и Лжедмитрия II члены Посольского приказа заняли разные стороны, поддерживая оба лагеря.

На развитие российского общества большое влияние оказывала Польша, которая стала источником европеизации страны в тяжелый период Смуты и первые годы восстановления после нее. Именно через Польшу начали проникать элементы европейского уклада жизни, менталитета и культуры. Под воздействием поляков российская политическая элита отказывалась от идеи превосходства собственного государства, которое ранее рассматривалось как «третий Рим». В самом обществе в России западноевропейские новшества воспринимались неоднозначно – дворяне и бояре видели в них попытку заместить великие российские традиции, а духовенство и значительная часть населения рассматривали заимствования католической Польши в качестве угрозы православию.