Из архиереев помимо председателя, архиепископа Омского Сильвестра, членами ВВЦУ стали архиепископ Симбирский и Сызранский Вениамин (Муратовский) и епископ Уфимский Андрей (Ухтомский).

Сибирское ВВЦУ обосновалось в Омске, по местопребыванию органов государственной власти. Его открытие состоялось 25 ноября 1918 г. после торжественного богослужения, на котором присутствовал Верховный правитель адмирал А. В. Колчак{122}, члены кабинета министров, дипломатический корпус и военные чины. В тот же день правительством было принято постановление о создании Главного управления по делам вероисповеданий при Министерстве внутренних дел. Функции контролирования деятельности ВВЦУ были переданы министру исповеданий.

При управлении вероисповеданий были созданы и другие церковные структуры. Приказом начальника штаба Верховного главнокомандующего № 56 от 28 декабря 1918 г. «для обслуживания духовных потребностей в войсках армии и флота, для поднятия в них религиозно-нравственного состояния и развития в защитниках Родины чувства патриотизма и преданности долгу» были введены должности главного священника армии и флота с управлением при Ставке Верховного главнокомандующего, а также священников фронтов, армий, отдельных корпусов и отдельных армейских групп, священно-церковнослужителей стрелковых, пехотных, казачьих и кавалерийских полков, госпиталей и лазаретов. В марте 1919 г. управление было переведено из Ставки в штаб Верховного главнокомандующего, а в октябре 1919 г. была введена должность епископа армии и флота при Военном министерстве.

В ноябре 1919 г. вместе с отступавшими частями Белой армии Управления епископа и главного священника армии и флота колчаковского правительства покинули Омск и перебрались в Иркутск. В январе 1920 г. колчаковское правительство прекратило свое существование. В феврале архиереи – члены Сибирского ВВЦУ – были арестованы советской властью по обвинению в «пособничестве Белой армии и антисоветской пропаганде». Вскоре после ареста председатель ВВЦУ архиепископ Омский и Павлодарский Сильвестр (Ольшевский) скончался. В ноябре архиепископ Симбирский и Сызранский Вениамин (Муратовский) и епископ Уфимский Андрей (Ухтомский) выступили с заявлением о своей лояльности к существующей власти и просьбой об освобождении, после чего их дело было прекращено{123}.

Под угрозой репрессий часть епископов, епархии которых оказались на территориях, занятых большевиками, вынуждены были эмигрировать. Трое из них были участниками Томского совещания 1918 г.: архиепископ Мефодий, епископ Мелетий и епископ Михаил. Их история такова.

Епископ Мефодий (Герасимов) возглавил Оренбургскую кафедру 30 июля 1914 г., в самом начале войны. В состав этой одной из самых обширных епархий Русской Православной Церкви входили тогда Оренбургская губерния и Тургайская область. Во время войны здесь оказались сотни тысяч беженцев, о которых требовалась неустанная забота. Для помощи беженцам епископ организовал Епархиальный Беженский комитет, который имел благочиннические и уездные отделы. Комитет помогал нуждавшимся найти приют, обеспечивал их питанием и одеждой, детям давал возможность получить образование. В самом Оренбурге для беженцев был устроен целый городок с собственной церковью, двухклассной школой, бесплатными столовыми, банями, лечебницей, амбулаторией и библиотекой.

Глава епархии принимал непосредственное участие в делах помощи фронту. Помимо Беженского комитета в Оренбурге были созданы такие учреждения, как Оренбургский епархиальный комитет Красного Креста, Военно-промышленный комитет и некоторые другие. Кроме сбора средств по всей епархии проводились сборы железа и жести для нужд чугунолитейного завода, на котором изготавливались артиллерийские снаряды, и мастерских, где производилось все необходимое для консервного завода и обозов. На епархиальные средства содержалось несколько госпиталей, которые часто посещал епископ.