Весной 68 г. были захвачены Антипатрус (около нынешнего Рош ѓа-Аина), Лод и Явне. После этого римские войска двинулись на восток, в Эдом и Перею – населенные евреями районы Заиорданья к югу от реки Ярмук. Повстанцы под командованием Шимона Бар-Гиоры провели ряд ответных операций против римских войск и поддерживающего их языческого населения. Широкомасштабные боевые действия продолжались до конца лета 69 г., когда под контролем повстанцев остались только Иерусалим и расположенные к юго-востоку от него крепости Геродион, Массада и Михвар.

Тем временем политические перемены произошли как в Риме, так и в Иерусалиме. После убийства заговорщиками императора Нерона Веспасиан был избран при поддержке легионеров императором и покинул Иудею, оставив вместо себя своего сына Тита. В Иерусалиме же вождь галилейских зелотов Иоханан из Гуш-Халава обвинил правительство умеренных в измене и возложил на них вину за утрату Галилеи. Призвав на помощь эдомитян, примыкавших к самым радикальным сторонникам восстания, он учинил резню умеренных. Были убиты, в частности, Ханан бен Ханан и Иеѓошуа бен Гамла. Опасаясь вождя иерусалимских зелотов Шимона бар Гиору, Иоханан отказался впустить его и его людей в город, но уцелевшие лидеры умеренных открыли ворота Шимону бар Гиоре, рассчитывая с его помощью избавиться от галилейских зелотов и эдомитян. В результате в Иерусалиме разгорелась полномасштабная гражданская война. Противоборствующие стороны объединились лишь после того, как Тит выдвинул свои войска непосредственно к стенам Иерусалима.

Осада и штурм Иерусалима и бои на его улицах продолжались пять месяцев, в ходе которых погибли сотни тысяч людей. 9 ава (в начале августа) 70 г. был захвачен и разрушен Второй Храм. После этого бои в Иерусалиме продолжались еще 18 дней. Тит приказал разрушить Иерусалим целиком, оставив лишь три башни из его укреплений – Гиппикус, Мирьям и Пцаэль. Однако борьба продолжалась еще два с половиной года. Повстанцы, удерживавшие три крепости в пустынных районах к юго-востоку от Иерусалима, продолжали оказывать ожесточенное сопротивление, пока в 73 г. не пала последняя из этих крепостей, Массада, обороной которой командовал Элеазар бен Яир.

После разрушения Иерусалима и Храма духовным центром еврейского народа стал город Явне, где по инициативе раббана Иоханана бен Закая, спасшегося из осажденного Иерусалима, была возобновлена деятельность Синедриона. Однако главой еврейского народа номинально все еще продолжал оставаться царь Агриппа II. Неоднократные попытки царя убедить восставших сложить оружие имели своей целью спасение Иерусалима и Храма. В своем наделе на северо-востоке Страны Израиля он воспрепятствовал истреблению евреев язычниками. Несмотря на это сотрудничество царя с римскими завоевателями, разрушителями Храма, окончательно лишило последнего представителя династии Иродиадов авторитета в глазах народа. После смерти Агриппы II в 92 (возможно, 96) г. римляне упразднили Иудейское царство и окончательно аннексировали его территорию.

В период правления Иродиадов снова усилились позиции греческого языка в Эрец Исраэль. Процесс вытеснения иврита арамейским языком в обиходном общении продолжался. Результатом подавления Великого восстания стало резкое сокращение численности еврейского населения, прежде всего в собственно Иудее, и разрушение основного центра еврейского народа – Иерусалима.

Разрушение Храма привело к радикальным переменам в религиозной жизни еврейского народа. Место первосвященников, служивших в Храме, заняли главы Синедриона, получившие наряду с религиозными и светские полномочия. Главы Синедриона этого периода обычно именуются в русскоязычной литературе патриархами. Правление патриархов, носивших еврейский титул «наси», продолжалось с упразднением римлянами Иудейского царства со смерти царя Агриппы II в 92 (возможно, 96) г. н. э. и до 429 г., когда после смерти последнего патриарха Гамлиэля VI византийские власти воспрепятствовали избранию нового патриарха.