К десантной высадке готовили часть сил армий – около 40 тыс. человек. Остальные соединения должны были переправиться после занятия и расширения плацдарма. Подготовка войск к осуществлению десанта была низкой. Тренировку в посадке и высадке проводил только 105-й стрелковый полк, предназначенный для высадки на необорудованный берег. Хорошую подготовку имела 79-я особая стрелковая бригада, состоявшая преимущественно из моряков[423].
Серьезная проблема, с которой столкнулось командование при планировании, заключалась в отсутствии специальных десантных судов и высадочных средств для столь масштабной операции. Транспортников и вспомогательных судов не хватало, учитывая потребности в обеспечении постоянных перевозок в блокированный с суши Севастополь. Приходилось привлекать мобилизованные суда и мелкие плавсредства гражданских организаций, которые, не имея специального оборудования, к тому же не обладали нужными мореходными характеристиками для десантной операции в тяжелых погодных условиях. Особенно сложное положение складывалось у Азовской флотилии, которая вынуждена была использовать для операции в том числе рыбацкие лодки и байды.
Пробоины в бортах «Взрывателя» были такого размера, что к одной из них приставили сходню для входа внутрь тральщика.
Другой не менее важной проблемой являлась активность немецкой авиации, базировавшейся в Крыму и угрожавшей кораблям и транспортникам в море. Предусматривалась авиационная поддержка десанта, но для его обеспечения флот смог выделить всего 161 самолет, в основном устаревших конструкций (из 279, находящихся в строю), в том числе 48 бомбардировщиков, 35 истребителей, 78 разведчиков МБР-2. Нерешенной проблемой оставалась удаленность имевшихся авиабаз от мест проведения операции, что затрудняло осуществление длительного и эффективного авиационного прикрытия десанта.
Важнейшей задачей являлось обеспечение скрытности в подготовке десантной операции. Было решено совершать погрузку войск и средств на суда исключительно в ночное время. Переход транспортов морем должен был осуществляться в отдалении от берега, под прикрытием в дневное время самолетами Пе-2.
Предварительная разведка обстановки в пунктах высадки и ближайших к ним районов была возложена преимущественно на подводников. Подлодка «М-51» установила отсутствие кораблей в порту Феодосии и наличие бонового заграждения у входа в порт. Подлодка «Щ-201» вела разведку в районе г. Опук. Она не выявила признаков оборонительных сооружений на берегу и работающих навигационных огней. 15 декабря в район Феодосии была заброшена разведгруппа, сообщившая о примерной численности гарнизона в 2 тыс. чел. и возможной заминированности причалов[424]. Воздушная разведка из-за метеоусловий не проводилась. Несмотря на полученные данные, свидетельствующие об отсутствии особых мер обороны в местах, предполагаемых для основного десанта, исходя из скопления войск противника в этих районах, следовало ожидать здесь серьезное сопротивление.
Общая численность группировки противника на Керченском полуострове составляла не более 25 тыс. человек. Здесь располагались части 42-го армейского корпуса 11-й немецкой армии Э. фон Манштейна: 46-я пехотная дивизия, 8-я кавалерийская бригада румын, два танковых батальона, два артиллерийских полка и пять зенитных артиллерийских дивизионов. Авиация была представлена двумя авиагруппами. Оборона была построена на основе опорных пунктов, имевших между собой огневую связь[425].
План десантной операции несколько раз корректировался. Ухудшение обстановки под Севастополем и необходимость оказания ему срочной помощи привели к переносу начала высадки с 21 на 26 декабря.