Примирение произошло в доме коменданта Петропавловска капитана Крупского, куда Иван Фёдорович Крузенштерн явился вместе с офицерами шлюпов «Надежда» в полной парадной форме. «Сей день был днём радости для всякого подчинённого, развязавшего судьбу многих. Начались обеды, ужины и вечеринки, а затем стали спешить с приготовлениями к японской экспедиции», —писал современник.
6-го сентября 1804 года шлюп «Надежда» снялся с якоря в Петропавловске и отправился в путь к берегам Японии. Утром 11-го сентября пошёл дождь при сильном восточном ветре, а затем начался шторм. В пять часов дня он уже свирепствовал вовсю. Утром шторм стих. Начал понемногу дуть свежий северный ветер, но Иван Фёдорович Крузенштерн не мог им воспользоваться из-за сильной зыби с востока. Во время шторма в корабле открылась большая течь, хотя на Камчатке он был тщательно проконопачен поверх медной обшивки. Позднее, в Нагасаки установили, что течь находится под медной обшивкой.
15-го сентября ненадолго показалось солнце. Скоро снова настала бурная погода. Дождь шёл непрерывно. Волнение на море было сильное. Попутный ветер гнал корабль вперёд со скоростью 8—9 узлов (17—19 километров) в час. Однако при большей скорости значительно увеличивалась течь. Температура воздуха поднялась до двадцати градусов тепла.
24-го сентября было первым хорошим днём с момента отплытия с Камчатки. Астроном Иоганн Каспар Горнер тотчас воспользовался этим обстоятельством для проверки хронометров.
Страна восходящего солнца
.Первый, чудный и тонкий луч,
Победивший ночи мрак,
Сквозь туманы прорезал путь
Восходящего солнца страну!
M. G.
По пути в Японию, 27 сентября, в день коронации императора Александра Павловича, на корабле состоялось большое торжество. Погода была великолепная.
Шлюп «Надежда» в море на пути в Японию.