«Дело «ВЕР», как в оперативных целях именовали подпольную контрреволюционную организацию «Великая Единая Россия», возникло из цепочки, казалось бы, случайных фактов о существовании глубоко законспирированной антисоветской организации, имевшей целью вооружённое выступление против власти большевиков. Где-то в начале октября 1918 года некто гражданин Филатов Л.К. сообщил о существовании в Петрограде белогвардейской организации. По поручению Яковлевой разведчик ЧК по фамилии Е. Алье в период с 14 по 31 октября 1918 года провёл разведку и проверку полученных сведений. Используя оперативные возможности, разведчик-чекист был представлен в «Петит-кафе» неизвестному гражданину как специалист по подрывному делу, поскольку тот искал подрывника для своей организации. Неизвестный оказался участником этой подпольной организации Кожиным В.В. Разведчик Алье получил от Кожина записку, адресованную начальнику охраны 1‐го участка Финляндской железной дороги Д.Д. Бутовскому. В результате последующих встреч удалось установить, что во главе белогвардейского подполья стоит некто Бутвиловский, а сама организация имеет официальное прикрытие в виде кооператива «Мирный труд».

Получив такие исходные данные, чекисты быстро установили квартиру Кожина, на которой оставили засаду. Всех приходивших на квартиру брали под арест для разбирательства. Спустя время в ЧК уже имелся некий список лиц, входивших в подпольную антисоветскую организацию. 28 октября Варвара Николаевна подписывает ордер на обыск и арест Кожина. Одновременно удаётся установить, что организация в целях конспирации построена по принципу масонских братств – группами по 5 человек. У подпольной организации есть программа политической партии «Великая Единая Россия».

Началась оперативная работа по аресту выявленных заговорщиков по делу братства «ВЕР». В числе первых 31 октября был задержан бывший капитан лейб-гвардии Преображенского полка 24‐летний Дмитрий Дмитриевич Бутовский. При нём оказалось удостоверение с фотографией, подтверждавшее, что он является инспектором для поручений при начальнике охраны Финляндской, Приморской и Ириновской железных дорог Петроградского округа путей сообщения. В документе указывалось, что Бутовский имеет право проживания и свободного передвижения в пределах вышеназванных дорог. При этом все совдепы, революционные власти должны были оказывать ему всяческое содействие при исполнении своих служебных обязанностей. Что и говорить, солидный документ.

Здесь надо ещё учитывать сложившуюся в те годы специфику охраны железных дорог. Во второй половине июля 1918 года был издан Декрет СНК «Об учреждении управления по охране путей сообщения при Народном комиссариате путей сообщения», согласно которому было создано Управление охраны, которому подчинялось 70 тысяч охранников железных дорог. При этом особо указывалось, что в состав охраны допускать лишь по рекомендациям рабочих, профессиональных и крестьянских организаций. Каким образом бывший офицер царской гвардии смог поступить на службу в охрану, чекистам ещё предстояло узнать.

А 7 августа того же года постановлением СНК в ВЧК был сформирован железнодорожный отдел, позже переименованный в транспортный отдел. Такие же отделы создавались в губернских и уездных ЧК. Зоны ответственности чекистов на железной дороге были ограничены полосой отчуждения. Все чины железнодорожной охраны должны были оказывать всяческое содействие агентам ЧК и выполнять их поручения. При этом агенты транспортного отдела ЧК контролировали действия охраны и взаимодействовали с ними. Выходит, что заговорщики, включая Бутовского, были рядом с чекистами на Финляндской и примыкающих к ней железных дорогах. Как отмечает известный историк П.Н. Базанов в своей книге «Братство Русской Правды – самая загадочная организация Русского Зарубежья», многие из «членов «ББК-ВЕР» были морскими офицерами и служили в охране Финляндской железной дороги»