Японская военщина вынуждена была отступить. Вторжение в МНР было отложено. Однако провокации на границах МНР не прекращались. В мае 1939 г. крупная японская армия, насчитывавшая десятки тысяч солдат, сотни танков, самолётов, многочисленную артиллерию, вторглась в МНР в районе Халхын-Гола. В результате длительных боёв советские войска в тесном боевом содружестве с частями МНР разбили армию интервентов и полностью очистили территорию МНР от врагов.

Учитывая огромные изменения, происшедшие в стране, X съезд Народно-революционной партии весной 1940 г. признал конституцию 1924 года не соответствующей новой социально-экономической обстановке страны и счёл необходимым разработать проект новой конституции. Этот проект был представлен на обсуждение 8-го Великого народного хурала, открывшегося 20 июня 1940 г. Новая конституция была единодушно утверждена Великим народным хуралом. Страна прочно вступила на путь некапиталистического развития, с тем чтобы в дальнейшем перейти к социализму.

Новый этап развития проходил в трудных условиях второй мировой войны, когда существовала угроза независимости страны со стороны милитаристской Японии.

ЦК МНРП, Президиум Малого хурала и Совет министров 22 июня 1941 г. на совместном заседании приняли решение, в котором заявили, что монгольский народ, «связанный узами кровной нерушимой дружбы с советским народом, с глубочайшим презрением заклеймит этот вероломный акт со стороны фашистской Германии, ответит всемерным усилением дружбы советского и монгольского народов, будет верен обязательствам, принятым на себя по договору о взаимной помощи, заключенному между МНР и СССР 12 марта 1936 г.» (Сборник законов и постановлений Правительства МНР, выпуск 2, 1941). По всей стране развернулось движение по сбору средств для строительства танковой колонны и эскадрильи самолётов в дар героической Красной Армии. Монгольский народ внёс свой вклад в борьбу свободолюбивых народов против фашистских агрессоров.

Партия и народная власть прилагали все усилия для всемерного развития народного хозяйства. Увеличилось производство продовольственных и фуражных культур, выросла пищевая промышленность, расширились старые и возникло много новых государственных и кустарно-промышленных кооперативных предприятий, развернувших производство предметов широкого потребления с использованием местного сырья. В стране с небывалой широтой развернулось патриотическое революционное соревнование, множились ряды передовиков животноводства и ударников промышленности и транспорта, В конце 1941 г. состоялось первое всереспубликанское совещание передовиков животноводства, в 1943 г. было созвано совещание ударников промышленности и транспорта, а также второе совещание передовиков животноводства. В результате огромного политического и трудового подъёма народных масс страна успешно преодолела трудности, связанные с обстановкой военного времени, и обеспечила новый значительный рост хозяйства и культуры.

В конце 1944 правительство МНР приняло решение о предоставлении избирательных прав тем гражданам МНР, которые были до этого лишены этих прав (ламы, феодалы и др.).

В августе 1945 г. 80-тысячная монгольская армия внесла свой вклад в разгром милитаристской Японии. После окончания войны международное положение МНР укрепилось. Правительство гоминьдановского Китая было вынуждено окончательно признать государственную независимость МНР. Договор о дружбе и взаимной помощи с СССР, подписанный в феврале 1946 г., обеспечил МНР безопасность от угрозы нападения извне.

В апреле 1949 г. делегация республики приняла участие в работе Первого Всемирного конгресса сторонников мира в Париже и Праге. Укрепление международного положения Монгольской Народной Республики сочеталось с углублением процесса демократизации общественной жизни страны. Были проведены мероприятия по укреплению хозяйственного аппарата республики и расширению организационно-хозяйственных функций государства. Углубление демократизма нашло также проявление в утвержденном в феврале 1949 г. Великим народным хуралом новом избирательном законе, который провозгласил всеобщее избирательное право, ликвидировав существовавшие прежде ограничения, введенные для эксплуататорских элементов. Закон упразднил также старую многостепенную систему выборов, заменив ее системой прямых выборов, установил единые и равные нормы представительства для всех групп населения, независимо от рода занятий, профессии, заменил принцип открытого голосования при выборах депутатов тайным голосованием, ввел право отзыва избирателями своего депутата. Согласно новому закону, депутату вменялось в обязанность периодически отчитываться перед избирателями в своей работе. Расширялись и права депутатов. В частности, депутат получил право запроса и право депутатской неприкосновенности. Соответственно изменился порядок выборов в участковые народные суды, которые стали осуществляться на основе всеобщего, прямого и равного избирательного права при тайном голосовании. Была проведена демобилизация армии, что дало народному хозяйству несколько тысяч тружеников, а также большое количество автомашин, различного оборудования. Сокращение военных расходов (на 50% с 1947 по 1952 г.) позволило выделить больше средств на финансирование народного хозяйства. Таким образом, были созданы благоприятные международные и внутренние социально-политические условия для общего подъема экономики и культуры республики.