Представление о природе заболеваний менялось по мере развития научных знаний об организме человека и окружающей среде. Объяснить природу патогенеза заболеваний живого организма пытались не только с позиций иммунологии, но и микробиологии, генетики, физиологии (нервизм, эндокринология и др.) и других разделов биологии и медицины. Каждое из этих направлений прошло свой путь развития. Основоположники научных направлений доказали многообразие типов связей между структурами организма и этим внесли огромный вклад в понимание отдельных сторон его жизнедеятельности при взаимодействии с внешней средой. Однако, каждое из этих направлений в отдельности создало лишь отрывочную картину патогенеза и, несмотря на дальнейшее их одностороннее развитие, также не привело к системной взаимосвязи всех иммунофизиологических факторов, объясняющих полный цикл адаптивной динамики процесса заболеваний на уровне целого организма. Это объясняется тем, что односторонние приверженности к тому или иному направлению биологической науки часто мешают рассмотреть пути, которые их сближают.

Кроме того, наметилась тенденция отхода от установленных истин. Например, у многих иммунологов стало меняться отношение к понятиям антиген-антитело. Так, В.Г.Говалло в брошюре “Этот многоликий иммунитет” [6] указывает, что в настоящее время концепция антигенов как противоположности антител допускается лишь в качестве рабочей схемы. Причину попыток заменить в специальной литературе эти термины на другие (иммуноглобулины) он объясняет тем, что стала известна способность антигенов вызывать иммунологические реакции без образования антител.

В биологии принято считать фагоцитоз и антитела самостоятельными способами иммунной защиты, не имеющими между собой взаимоотношений. При этом фагоцитарной функции приписывались свойства неспецифической иммунной защиты, а антителообразующей – специфической.

В течение ста с лишним лет биология достигла огромных успехов при изучении состава и свойств многих систем организма (иммунной, нервной, эндокринной и др.). Мы несравненно лучше стали понимать многие механизмы патогенеза отдельных заболеваний. Однако отсутствие представлений о связи между иммунными и физиологическими механизмами не дает полного понимания о природе общего механизма адаптации организма при взаимодействии с антигеном внешней среды.

До настоящего времени не были установлены законы физиологических основ в развитии иммунных процессов, не выяснена роль органов неспецифической регуляции (нервная и эндокринная системы) в развитии процесса иммуноприспособления. Только при разрешении этой проблемы возможен феномен появления нового направления в биологии и медицине – иммунофизиологии. Этот раздел науки в состоянии отобразить все стороны процесса адаптации к чужеродному антигену, способен соответствовать прогрессивному развитию представлений в данном направлении.

Одной из главных задач физиологической иммунологии является вопрос детального изучения и объединения механизмов патогенетических превращений в сложных процессах, происходящих при взаимодействии иммунных и физиологических факторов организма и направленных на построение структуры патогенеза в виде развернутой цепи при таких заболеваниях как анафилаксия и инфекционные заболевания (оспа, дифтерия, скарлатина и др.).

Современной науке уже недостаточно знаний в виде разрозненных фактов и явлений, связанных с объяснением отдельных сторон деятельности живого организма. Устоявшиеся знания нуждаются в корректировке старого новым. Это позволит разрешить вопрос: как взаимодействия физиологических и иммунологических механизмов живого организма справляются с вторжением чужеродных антигенов (белковых и инфекционных)?