Но счастье было недолгим. Неожиданно все круто изменилось, пошло прахом. В Ажан пришла чума. Нострадамус вступил в бой со страшной болезнью и спас тысячи жизней, но не смог уберечь три самых дорогих для него существа, погибли его жена и дети. И этот удар был не последним для талантливого врачевателя.

Многочисленные завистники и конкуренты обвинили его в ереси, и Нострадамусу было предписано явится перед судом святой инквизиции в Тулузе. Под покровом ночи он бежал в Италию. У историков нет однозначного мнения, что было потом, – считается, что именно в это время «семилетней Одиссеи», в изгнании, у него и открылся пророческий дар, сделавший его бессмертным.

В 1545 году Михаил Нострадамус объявляется в Марселе как помощник врача Луи Серра, возглавившего борьбу с грозной эпидемией. В борьбе с эпидемией Нострадамус проявил мужество, находчивость и самообладание. В столице Прованса, на момент его прибытия в живых не было уже ни одного врача. В течение последующих трехсот дней он, не покладая рук, боролся со смертельной заразой. Им было составлено лекарство от мора, основанное на убеждении, что цветы и травы в руках опытного врача могут сделаться сильно действующим средством. Но дело не в одной лекарственной формуле. Нострадамус предвосхитил санитарные и профилактические мероприятия более поздних времен. По его приказу с улиц городов убрали все трупы, жителям было предписано соблюдать строгие правила гигиены, а свои знаменитые пилюли он бесплатно раздавал на улицах. Врач победил болезнь – чума отступила. Мишель Нострадамус превратился в национального героя. За победу на эпидемией муниципалитет Экса наградил его пожизненной пенсией. Но врач не спешил почивать на лаврах и в течение еще трех лет переезжал из города в город вслед за чумой.

С 1547 года до своей смерти Нострадамус обосновывается в Салоне – небольшом городке между Авиньоном и Марселем. Там он женится на вдове Анне Понсар-Джемелье (ее называют еще Пуссар); у него появляется новая семья – сыновья (Цезарь, Андре и Карл), дочери (Мадлен, Диана, Анна). Днем он врачевал и помогал нуждающимся, а ночью, склонившись над бумагами, непрерывно писал. Писал свои послания в будущее, к людям, которые еще не родились. Многие знатные и богатые люди обращались к нему за советом.